ClinVar数据库

ClinVar 数据库
ClinVar Database

NCBI 全球遗传变异临床意义档案馆
管理机构	NCBI / NLM / NIH
核心功能	变异致病性汇总
数据标准	ACMG/AMP 指南
评估体系	星级评审 (Star Rating)
访问权限	免费 / 公开 (Open Access)

ClinVar 是由美国国家生物技术信息中心（NCBI）主办的一个公共档案馆，专门用于收集和整合人类基因组变异与其临床意义（表型）之间的关系证据。ClinVar 接收来自全球实验室、临床医生、专家小组及科研机构的提交资料，并将这些变异根据 **ACMG变异分类标准** 标记为致病（Pathogenic）、良性（Benign）或意义不明（VUS）等类别。

在 2025 年，ClinVar 不仅是变异查询的工具，更是实现基因组医学“众包解读”的核心平台。通过对不同机构提交证据的对比，ClinVar 能够识别出解读分歧（Conflict），从而推动变异致病性的全球共识达成。

星级评审体系 (Review Status)

为了解决不同提交者之间可能存在的结论冲突，ClinVar 采用了一套名为“星级评审”的质量评价体系。星级越高，代表该变异结论的可靠性和共识度越高。

ClinVar 评审状态与证据可信度评估 (2025 版)

评审级别	定义名称	临床解读参考价值
**0 星**	No assertion criteria	仅提交了变异，未提供判定致病性的标准。**参考价值极低**。
**1 星**	Single submitter	由单个实验室提交。临床中常用，但若存在多个 1 星结论且不一致，则会产生**冲突 (Conflict)**。
**2 星**	Multiple submitters	多个独立实验室提交了相同的结论且无冲突。**临床可信度较高**。
**3 星**	Expert panel	经过国际公认的专家小组（如 ClinGen）评审。**临床公认的金标准**。
**4 星**	Practice guideline	已被纳入正式的临床诊疗指南。**最高级别证据**。

2025 年临床应用核心价值

1. **解决变异解读冲突**：当临床报告出现 Class 3 (VUS) 时，遗传咨询师会查阅 ClinVar。如果发现该变异在 ClinVar 中有多个近期提交的 2 星“致病”结论，则为 VUS 的升级定级提供了强力支撑。
2. **监测证据动态更新**：ClinVar 的数据每两周更新一次。2025 年的自动化流程允许临床机构在 ClinVar 变异定级发生变化时（例如从 VUS 变更为致病），自动触发对患者历史报告的重新审核。
3. **支持 HRDetect评分系统 与 AI 解读**：ClinVar 中的大量“良性”和“致病”数据集是训练如 **AlphaMissense** 等变异预测模型的基石。
4. **驱动精准治疗**：对于 **奥拉帕利** 等药物，ClinVar 提供的变异临床意义直接决定了患者是否具备用药指征。

参考文献 (经严格校对)

• [1] **Landrum MJ**, et al. ClinVar: public archive of interpretations of clinically relevant variants. Nucleic Acids Research. 2018;46(D1):D1062-D1067. doi:10.1093/nar/gkx1153. (ClinVar 核心奠基文献)
• [2] **Landrum MJ**, et al. ClinVar: improving access to variant interpretations and supporting standards. Nucleic Acids Research. 2020;48(D1):D835-D844.
• [3] **Rehm HL**, et al. ClinGen — The Clinical Genome Resource. New England Journal of Medicine. 2015;372(23):2235-2242. (关于专家小组评审 3 星标准的定义)
• [4] **NCBI Insights**. ClinVar 2025 Update: Integration of High-Throughput Functional Evidence. National Center for Biotechnology Information. Published Jan 2025.

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