肿瘤突变负荷
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肿瘤突变负荷[编辑 | 编辑源代码]
文件:TMB Immune Response.jpg
TMB 预测免疫疗效的机制:TMB 越高 $\rightarrow$ 产生的新抗原越多 $\rightarrow$ 被 T 细胞识别并杀伤的概率越大。
肿瘤突变负荷(Tumor Mutational Burden,简称 TMB),是指肿瘤基因组中特定区域内去除胚系突变后的体细胞突变总数。通常以每兆碱基(Mb)中的突变数量(muts/Mb)来表示。
TMB 是反映肿瘤细胞基因组不稳定性的量化指标。临床研究证实,高 TMB (TMB-H) 的肿瘤往往产生更多的 新抗原 (Neoantigens),从而具有更强的免疫原性,对 免疫检查点抑制剂 (如 PD-1/PD-L1 抗体) 的响应率更高。
基本信息[编辑 | 编辑源代码]
| 中文名称 | 肿瘤突变负荷 |
|---|---|
| 英文名称 | Tumor Mutational Burden (TMB) |
| 计量单位 | muts/Mb (突变数/兆碱基) |
| 通用阈值 | 通常 $\ge 10$ muts/Mb 定义为 TMB-H (高) |
| 检测方法 | 全外显子测序 (WES) 或 大 Panel |
| 临床意义 | 预测 PD-1/PD-L1 疗效、筛选癌症疫苗受试者 |
生物学机制[编辑 | 编辑源代码]
TMB 预测免疫疗效的逻辑链条如下:
- 突变累积:肿瘤细胞发生大量体细胞非同义突变。
- 新抗原产生:突变的 DNA 转录翻译出异常的蛋白质(含有氨基酸序列改变),这些异常肽段被称为新抗原 (Neoantigens)。
- 抗原呈递:新抗原被 MHC 分子呈递到肿瘤细胞表面。
- 免疫识别:T 细胞(特别是 CD8+ T 细胞)识别这些“非己”的抗原,从而被激活并杀伤肿瘤。
- 结论:TMB 越高,产生能被免疫系统识别的新抗原的概率就越大,肿瘤就越“热”,PD-1 抑制剂“松开刹车”后的效果就越好。
检测方法[编辑 | 编辑源代码]
1. 全外显子测序 (WES)[编辑 | 编辑源代码]
- 地位:计算 TMB 的金标准。
- 方法:统计约 30-50 Mb 编码区内的非同义突变总数。
- 缺点:成本高,分析时间长,临床普及度不如 Panel。
2. 靶向测序 Panel[编辑 | 编辑源代码]
- 地位:临床主流检测方式。
- 要求:为了保证与 WES 结果的高度相关性,用于计算 TMB 的 Panel 覆盖范围通常要求 $\ge 1.0$ Mb(即所谓的“大 Panel”)。
- 算法:需剔除胚系突变(Germline mutation)和常见的驱动基因突变(如 EGFR),以免干扰计算。
临床应用与阈值[编辑 | 编辑源代码]
1. 泛癌种伴随诊断[编辑 | 编辑源代码]
2020年,FDA 批准帕博利珠单抗(Pembrolizumab, PD-1抑制剂)用于治疗 TMB-H ($\ge 10$ muts/Mb) 的不可切除或转移性实体瘤患者,无论其肿瘤组织来源。这是继 微卫星不稳定性 (MSI-H) 之后,第二个获批的“不限癌种”生物标志物。
2. 肺癌[编辑 | 编辑源代码]
在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中,TMB 曾被尝试作为一线免疫治疗的筛选指标,但在不同临床试验(如 CheckMate-227)中结果存在争议,目前多作为辅助参考指标,而非绝对标准。
局限性[编辑 | 编辑源代码]
- 同义突变的干扰:部分 Panel 计算 TMB 时包含同义突变,可能高估免疫原性。
- 不完全对应:并非所有突变都会产生能被 MHC 呈递的新抗原(受 HLA 分型限制)。因此,新抗原负荷 (TNB) 理论上比 TMB 更精准,但检测难度更大。
- 癌种特异性:不同癌种的 TMB 基线不同。例如,黑色素瘤的“低 TMB”可能比胰腺癌的“高 TMB”数值还要高,因此跨癌种比较需谨慎。
参考文献[编辑 | 编辑源代码]
- [1] Yarchoan M, Hopkins A, Jaffee EM. Tumor Mutational Burden and Response Rate to PD-1 Inhibition. N Engl J Med. 2017. (经典文献:揭示了 TMB 与 ORR 的线性正相关关系)
- [2] Chalmers ZR, et al. Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden. Genome Med. 2017.
- [3] FDA Approval: FDA approves pembrolizumab for adults and children with TMB-H solid tumors. 2020.