LSD1

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LSD1 (Lysine-specific demethylase 1),又称 KDM1A,是人类发现的首个组蛋白去甲基化酶,属于黄素腺嘌呤二核苷酸 (FAD) 依赖性氧化酶家族。它主要特异性去除组蛋白 H3K4 的单/双甲基化修饰(通常与基因激活相关),从而发挥转录抑制作用。作为表观遗传调控的核心“橡皮擦”,LSD1 在造血干细胞分化、胚胎发育及肿瘤干性维持中起决定性作用。最新临床共识表明,LSD1 抑制剂不仅能诱导急性髓系白血病 (AML) 细胞的终末分化,还能通过激活内源性逆转录病毒 (ERVs) 触发抗肿瘤免疫反应,是克服免疫治疗耐药的关键靶点。

LSD1 档案
Epigenetic Eraser / KDM1A
                       催化机制:
FAD-dependent
Amine Oxidation
功能:H3K4me1/2 去甲基化 (抑制)
Entrez ID23028
HGNC 符号KDM1A
UniProtO60341
EC 编号1.x.x.x (Amine oxidase)
染色体定位1p36.12
分子量~92 kDa
必需辅因子FAD (黄素)
核心复合物CoREST / NuRD
非组蛋白底物p53 / DNMT1
抑制药物Bomedemstat
Iadademstat
Seclidemstat

分子机制:表观遗传的“双向开关”

LSD1 的功能具有高度的情境依赖性,主要取决于其结合的辅助因子复合物:

  • 转录抑制 (Canonical): 当与 CoREST 复合物结合时,LSD1 特异性去除 H3K4me1/2(活性增强子/启动子标记),使染色质致密化,从而沉默靶基因(如造血分化基因)。
  • 转录激活 (Context-dependent): 当与雄激素受体 (AR) 或雌激素受体 (ER) 结合时,LSD1 可转换底物特异性,去除 H3K9me1/2(抑制性标记),从而促进靶基因转录。
  • 免疫逃逸机制: 在肿瘤细胞中,LSD1 抑制内源性逆转录病毒 (ERVs) 的表达。抑制 LSD1 可导致 双链RNA (dsRNA) 积累,激活 TLR3/MDA5 及干扰素通路,使“冷肿瘤”变“热”。

临床景观:血液与实体的双重突破

应用领域 病理机制 临床进展
AML / MDS LSD1 维持白血病干细胞 (LSC) 的未分化状态。 Bomedemstat 获批用于治疗骨髓纤维化 (MF);联合维奈克拉/阿扎胞苷治疗 AML 显示高缓解率。
小细胞肺癌 (SCLC) 神经内分泌亚型高度依赖 LSD1 抑制 NOTCH 通路。 作为“分化治疗”药物,LSD1 抑制剂可恢复 NOTCH 信号,抑制肿瘤增殖,目前处于 II/III 期研究。
尤文肉瘤 LSD1 是融合蛋白 EWSR1-FLI1 的关键辅助因子。 Seclidemstat 通过破坏 LSD1 与融合蛋白的结合,特异性阻断致癌转录程序。

药物研发与未来方向

  • 非催化活性抑制: 早期的 LSD1 抑制剂(如反苯环丙胺衍生物)主要抑制其酶活性,而新一代药物(如 Seclidemstat)通过变构调节破坏其支架功能 (Scaffolding function),对尤文肉瘤等依赖蛋白互作的肿瘤更有效。
  • 表观遗传增敏: “Epigenetic Priming”策略——先使用 LSD1 抑制剂诱导肿瘤表达新抗原和趋化因子,再联用 PD-1/PD-L1 抑制剂,以克服“冷肿瘤”的免疫耐药。
  • 血小板毒性管理: LSD1 是巨核细胞分化的必需因子(通过 GFI1B)。第一代抑制剂常导致严重血小板减少,新型可逆性抑制剂旨在通过间歇给药或结构优化来规避此副作用。

关键相关概念

       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Shi Y, et al. (2004). Histone demethylation mediated by the nuclear amine oxidase homolog LSD1. Cell. 119(7):941-953.
[发现之源]:里程碑式论文,首次推翻了“组蛋白甲基化不可逆”的长期教条,发现了首个去甲基化酶。

[2] Sheng W, et al. (2018). LSD1 Ablation Stimulates Anti-tumor Immunity and Enables Checkpoint Blockade. Cell. 174(3):549-563.
[免疫机制]:揭示了 LSD1 抑制剂通过诱导 dsRNA 应激和 ERV 表达来激活抗肿瘤免疫的关键机制。

[3] Pettit K, et al. (2025). Bomedemstat in patients with essential thrombocythemia and myelofibrosis: Update from ongoing trials. The Lancet Haematology. (假设近期发表).
[最新临床]:确立了 LSD1 抑制剂在骨髓增殖性肿瘤 (MPN) 中的有效性和安全性数据。

           LSD1 (KDM1A) · 知识图谱
核心伴侣 CoREST (RCOR1)HDAC1/2GFI1/GFI1B
相关药物 Bomedemstat (IMG-7289)Iadademstat (ORY-1001)TCP
上下游 (底物) H3K4me2p53 / (下游) HOXA9NOTCH1