MTAP

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MTAP(Methylthioadenosine Phosphorylase),即甲硫腺苷磷酸化酶。这是甲硫氨酸补救途径(Methionine Salvage Pathway)中的一种关键代谢酶。MTAP 基因位于人类染色体 9p21.3 区域,紧邻著名的抑癌基因 CDKN2A(编码 p16 和 p14)。在多种恶性肿瘤(如胶质母细胞瘤胰腺癌间皮瘤)中,CDKN2A 的纯合缺失往往连带导致 MTAP 的“旁系缺失”(Collateral Deletion)。这种缺失导致底物 MTA(甲硫腺苷)在细胞内异常积聚,进而选择性抑制 PRMT5 甲基转移酶活性。这一独特的代谢-表观遗传漏洞,使得 MTAP 缺失的肿瘤细胞对 PRMT5 抑制剂或 MAT2A 抑制剂表现出高度的合成致死敏感性,是目前“不以致癌基因为靶点”的精准治疗典范。

MTAP · 基因档案
Gene & Protein Profile (点击展开)
甲硫氨酸补救酶 / 9p21 旁系缺失
基因符号 MTAP
全称 S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase
染色体位置 9p21.3
Entrez ID 4507
HGNC ID 7413
UniProt Q13126
关键底物 MTA (甲硫腺苷)
连带缺失基因 CDKN2A, CDKN2B

分子机制:代谢产物与表观遗传的串扰

MTAP 的功能缺失不仅是代谢途径的阻断,更引发了深刻的表观遗传重塑,这是其成为治疗靶点的核心逻辑。

  • 甲硫氨酸补救途径: 正常情况下,MTAP 催化多胺合成的副产物 MTA 生成腺嘌呤和 MTR-1-P,后者最终被回收合成甲硫氨酸和 ATP。MTAP 是人体内唯一能代谢 MTA 的酶。
  • MTA 积聚与 PRMT5 抑制:
    在 MTAP 缺失的肿瘤中,底物 MTA 浓度急剧升高(可达正常细胞的 10-100 倍)。
    MTA 在结构上与甲基供体 SAM (S-腺苷甲硫氨酸) 极度相似。高浓度的 MTA 充当 SAM 的竞争性抑制剂,特异性结合并抑制精氨酸甲基转移酶 PRMT5 的活性。这种“部分抑制”使肿瘤细胞处于一种极度依赖剩余 PRMT5 活性的脆弱状态。
  • 合成致死原理:
    由于 MTAP 缺失细胞中的 PRMT5 活性已经被内源性 MTA 部分抑制,如果再使用外源性药物进一步抑制 PRMT5 或其上游的 MAT2A(负责合成 SAM),会导致 PRMT5 功能彻底崩溃,引发 RNA 剪接异常和 DNA 损伤,最终导致细胞死亡。而正常细胞由于 MTAP 存在,MTA 水平低,能耐受一定程度的药物抑制,从而形成治疗窗口。

临床景观:广泛存在的旁系缺失

MTAP 缺失本身不是致癌驱动力,而是肿瘤切除 9p21 上的抑癌基因 CDKN2A 时发生的“连带损伤”(Collateral Damage)。

癌种 缺失频率 (Homozygous) 临床特征
胶质母细胞瘤 (GBM) ~40-50% MTAP/CDKN2A 共缺失是 GBM 最常见的遗传改变之一,通常预示着肿瘤侵袭性强,也是 MAT2A 抑制剂临床试验的重点人群。
恶性胸膜间皮瘤 ~40% IHC 检测 MTAP 蛋白缺失已成为诊断肉瘤样间皮瘤(Sarcomatoid Mesothelioma)的重要辅助手段,因其特异性高达 100%。
胰腺导管腺癌 (PDAC) ~25% SMAD4 和 MTAP/CDKN2A 缺失是胰腺癌分子分型的重要特征。
非小细胞肺癌 (NSCLC) ~15% 主要是鳞状细胞癌亚型。目前正在探索 MTAP 缺失肺癌患者对 PRMT5 抑制剂的响应。

治疗策略:利用代谢漏洞进行合成致死

针对 MTAP 缺失肿瘤的药物研发正处于爆发期,核心策略是进一步打击受损的 PRMT5 轴。

  • MTA 协同性 PRMT5 抑制剂:
    MRTX1719AMG 193
    *机制创新:与第一代非选择性 PRMT5 抑制剂不同,这类新型药物优先结合 MTA-PRMT5 复合物,而非 SAM-PRMT5 复合物。
    *优势:这意味着药物只在 MTA 高积累(即 MTAP 缺失)的肿瘤细胞中发挥作用,极大地降低了对正常骨髓细胞的毒性,显著拓宽了治疗窗口。
  • MAT2A 抑制剂:
    IDE397
    *机制:MTAP 缺失细胞为了维持 SAM 水平,代偿性地上调 MAT2A。抑制 MAT2A 会耗竭细胞内的 SAM,使 PRMT5 更加暴露于 MTA 的抑制之下,导致合成致死。

关键关联概念

  • 9p21 人类基因组中最著名的抑癌基因座,包含 CDKN2A/B 和 MTAP。
  • 合成致死 MTAP 缺失与 PRMT5/MAT2A 抑制剂之间的关系。
  • MTA (甲硫腺苷): MTAP 的底物,也是内源性的 PRMT5 抑制剂。
  • PRMT5 精氨酸甲基转移酶,调控 RNA 剪接和基因表达。
  • 旁系缺失 (Collateral Deletion): 肿瘤切除抑癌基因时意外丢失邻近基因的现象。
       学术参考文献与权威点评
       

[1] Kryukov GV, et al. (2016). MTAP deletion confers enhanced dependency on the PRMT5 arginine methyltransferase complex. Science.
[学术点评]:奠基之作。Broad 研究所团队首次揭示了 MTAP 缺失肿瘤对 PRMT5 的依赖性,并阐明了 MTA 积累作为内源性抑制剂的机制,开启了该领域的药物研发热潮。

[2] Mavrakis KJ, et al. (2016). Disordered methionine metabolism in MTAP/CDKN2A-deleted cancers leads to dependence on PRMT5. Science.
[学术点评]:同期背靠背发表。独立证实了 MTAP-PRMT5 的合成致死关系,重点阐述了代谢重编程如何转化为治疗靶点。

[3] Marjon K, et al. (2016). MTAP Deletion Sensitizes to MAT2A Inhibition in Cancer Cells and Tumor-Bearing Mice. Cell Reports.
[学术点评]:MAT2A 靶点确认。证明了不仅是 PRMT5,上游的 MAT2A 也是 MTAP 缺失肿瘤的极佳靶点,为 IDE397 等药物的开发奠定了基础。

[4] Mulvaney KM, et al. (2021). Molecular basis for substrate recruitment to the PRMT5 methylosome. (相关药物机理:Cancer Discovery, 2022).
[学术点评]:药物设计突破。揭示了 MTA-cooperative PRMT5 抑制剂(如 MRTX1719)的结构基础,解释了为何这类药物能选择性杀伤 MTAP 缺失细胞而保护正常细胞。

[5] Hmeljak J, et al. (2014). Integrative molecular characterization of malignant pleural mesothelioma. Cancer Discovery.
[学术点评]:临床相关性。详细描绘了间皮瘤中 9p21/MTAP 缺失的基因组图谱,确立了其作为不良预后标志物的地位。

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