正构抑制
正构抑制(Orthosteric Inhibition),又称竞争性抑制(Competitive Inhibition),是药物设计中最经典、最常见的作用模式。此类抑制剂能够特异性识别并结合到靶标蛋白(酶、受体或离子通道)的活性位点(Active Site)或配体结合域(LBD)——即内源性配体(如 ATP、乙酰胆碱)原本结合的位置。药物分子通过立体位阻效应,“占据”这一关键位点,物理性地阻断内源性配体的结合,从而抑制信号传导。目前临床上获批的小分子药物(如第一代 EGFR-TKI)绝大多数属于正构抑制剂。
分子机制:一把钥匙开一把锁
正构抑制的核心逻辑是“分子拟态”(Molecular Mimicry):
- 占位效应: 药物分子的化学结构经过精心设计,通常包含一个模仿内源性底物(如 ATP 的腺嘌呤环)的骨架。这使得药物能够完美楔入酶的活性口袋。
- 竞争博弈: 正构抑制剂与内源性底物在活性位点上存在动态竞争,遵循质量作用定律。
• 如果 [药物] >> [底物]:酶被药物占据,处于无活性状态。
• 如果 [底物] >> [药物]:大量的底物会将药物“挤走”,恢复酶的活性。这就是为什么在高 ATP 浓度的细胞环境中,某些激酶抑制剂的效果会打折。 - 构象类型:
• I 型抑制剂: 结合于激酶的活性构象(DFG-in),典型的 ATP竞争者(如吉非替尼)。
• II 型抑制剂: 结合于激酶的非活性构象(DFG-out),但也占据 ATP 口袋(如伊马替尼)。
挑战:同质化的困局
为什么容易“脱靶”?
在进化过程中,许多蛋白(尤其是激酶组)的活性位点是高度保守的。
例如,人体内有 500 多种激酶,它们的 ATP 结合口袋长得非常像。这就导致针对某一激酶设计的正构抑制剂,很容易“误伤”其他激酶(脱靶效应),引起副作用(如皮疹、腹泻、心脏毒性)。
相比之下,变构抑制结合的位点在进化上变异度较大,因此更容易实现高选择性(如 BLU-945)。
进化:从竞争到“锁死”
为了克服正构抑制剂“可被高浓度底物挤走”的弱点,科学家开发了共价抑制剂(Covalent Inhibitor,如 奥希替尼):
| 类型 | 可逆正构 (1代 TKI) | 不可逆正构 (3代 TKI) |
|---|---|---|
| 结合方式 | 氢键、范德华力 (弱) | 共价键 (强) |
| 底物竞争 | 受 ATP 浓度影响 | 不受影响 (一旦结合,永久锁死) |
| 持续时间 | 取决于血药浓度 | 取决于蛋白周转率 (Turnover) |
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Copeland RA. (2005). Evaluation of enzyme inhibitors in drug discovery. Methods of Biochemical Analysis.
[点评]:药物研发领域的圣经,系统阐述了竞争性抑制的酶动力学原理及其在药物筛选中的应用。
[2] Zhang, J., et al. (2009). Targeting cancer with small molecule kinase inhibitors. Nature Reviews Cancer.
[点评]:总结了激酶抑制剂的发展历程,详细比较了 I 型(活性构象结合)和 II 型(非活性构象结合)正构抑制剂的优劣。
[3] Fang, Y. (2012). Ligand-receptor interaction platforms and their applications for drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery.
[点评]:探讨了如何通过生物物理学方法区分正构结合与变构结合。