ISCN
ISCN(International System for Human Cytogenomic Nomenclature,人类细胞基因组学国际命名体制)是描述人类染色体核型异常及基因组变异的全球通用标准语言。
它由人类细胞基因组命名常务委员会(ISCN 常委)制定,并由 S. Karger 出版社定期更新(如 2016、2020、2024 版)。它规定了如何用简洁的字符串来记录染色体的数目、形态、带纹以及分子水平的异常(如 FISH 和 CMA 结果)。
对于临床遗传学家而言,ISCN 就像是“语法书”,确保了全球实验室对 46,XY,t(9;22)(q34;q11) 这样的描述具有唯一且准确的理解。
解码基因天书:ISCN 语法结构
一个标准的 ISCN 核型描述遵循严格的“三段式”结构:染色体总数,性染色体组成,异常描述。
46, XX, t(9;22)(q34;q11)
- 46:染色体总数(Number)。
- XX:性染色体(Sex Chromosomes)。
- t:异常类型(Aberration),此处为易位(Translocation)。
- (9;22):涉及的染色体编号。
- (q34;q11):断裂点(Breakpoints)。即 9 号染色体长臂 3 区 4 带与 22 号染色体长臂 1 区 1 带发生交换。
常用符号对照表 (Abbreviations)
| 符号 | 全称 | 含义与示例 |
|---|---|---|
| + / - | Gain / Loss | 放在染色体前表示整条增减。 例: +21 (21三体) |
| del | Deletion | 染色体片段缺失。 例: del(5)(q13) |
| der | Derivative Chromosome | 衍生染色体(结构重排后的产物)。 例: der(22) |
| inv | Inversion | 倒位(染色体片段颠倒 180°)。 例: inv(16) (M4Eo型白血病) |
| mos | Mosaicism | 嵌合体(体内存在两种细胞系)。 例: 45,X[10]/46,XX[20] |
关键相关概念 [Key Concepts]
1. p arm / q arm: 染色体的基本解剖结构。着丝粒(Centromere)将染色体分为两部分:短臂命名为 p (法语 petit,小),长臂命名为 q (p 之后的字母)。
2. Idiogram (模式图): 根据 ISCN 标准绘制的染色体带纹地图。它定义了每个染色体带(Band)的界限和编号(如 1p36.1),是遗传学家定位基因的“谷歌地图”。
3. Cytogenomic (细胞基因组学): ISCN 名称的演变(从 Cytogenetic 到 Cytogenomic)反映了技术的进步。现在的命名系统不仅包含核型,还融合了 FISH(荧光原位杂交)和 Microarray(基因芯片)的描述规则(如 arr[GRCh37])。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] McGowan-Jordan J, et al. (Editors). (2020). ISCN 2020: An International System for Human Cytogenomic Nomenclature. Karger.
[点评]:经典版本(蓝紫色封面)。确立了结合 NGS 和 CMA 技术的现代命名规则,是目前实验室最常用的参考标准之一。
[2] Denver Conference. (1960). A proposed standard system of nomenclature of human mitotic chromosomes. Lancet.
[点评]:历史起源。在丹佛会议上,科学家们首次尝试统一混乱的染色体命名,奠定了 ISCN 的雏形。