高通量测序仪

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高通量测序仪(High-Throughput Sequencer),又称下一代测序仪 (NGS Sequencer),是现代生命科学研究的“显微镜”和“望远镜”。它通过大规模并行测序(Massively Parallel Sequencing)技术,能够在短时间内(几小时至几天)对数亿甚至数十亿条 DNA 分子进行同步测序。
与第一代 Sanger测序 相比,高通量测序仪将基因组测序的成本降低了超过 100 万倍(超越了 摩尔定律),使得“千元基因组”成为现实。目前市场主流设备分为以 Illumina华大智造 (MGI) 为代表的二代测序(短读长、高通量、高精度),以及以 PacBioOxford Nanopore 为代表的三代测序(长读长、单分子、实时)。

高通量测序仪
High-Throughput Sequencer (点击展开)
基因组时代的超级引擎
设备属性
所属领域 生物技术, 精密仪器
核心指标 通量 (Data Output), Q30
核心组件 流动槽 (Flow Cell), 光学系统
主流厂商
短读长 (NGS) Illumina, 华大智造
长读长 (TGS) PacBio, Oxford Nanopore
应用场景 WGS, 单细胞测序
挑战 海量数据存储与分析

技术流派:光与电的竞争

虽然市面上有多种测序仪,但其核心逻辑都是捕捉核苷酸聚合过程中的信号。目前主导市场的两大技术流派如下:

厂商 核心原理 技术特点
Illumina 桥式PCR + SBS (边合成边测序) 利用可逆终止子。读长通常为 PE150。市场占有率最高,生态系统最完善。
华大智造 (MGI) DNBSEQ (DNA纳米球) + cPAS 利用滚环复制 (RCA) 线性扩增,无 PCR 错误累积。结合规则阵列芯片,通量极高(如 T7),成本极低。
PacBio SMRT (单分子实时测序) HiFi Reads。读长可达 10-20kb,且准确率极高 (>99.9%)。适合基因组组装和变异检测。
Oxford Nanopore 纳米孔测序 DNA 穿过蛋白孔引起的电流变化。超长读长 (>100kb),便携(U盘大小),可直接测序 RNA。

核心组件:流动槽 (Flow Cell)

测序仪的“心脏”是流动槽 (Flow Cell),这是一个刻有微流控通道的玻璃芯片。

  • 功能: 它是 DNA 文库片段附着、扩增(成簇)和发生生化反应的场所。
  • 演进: 从早期的随机分布(Random),发展到现在的规则阵列 (Patterned)
    Illumina: 在纳米孔中预埋引物,实现 ExAmp。
    MGI: 利用光刻技术制造活性位点,带负电的 DNB 自动落入带正电的位点,实现超高密度加载。
  • 意义: 规则阵列消除了簇重叠(Overlapping)问题,大幅提升了数据产出和图像处理速度。

战略影响:组学基建

高通量测序仪已成为类似于电子显微镜的基础科研设施,但其意义远超科研工具:
临床诊断: 支撑了 NIPT、肿瘤伴随诊断、病原宏基因组检测等千亿级市场。
数据主权: 拥有自主可控的测序仪(如华大智造的设备)对于国家生物安全(遗传资源保护)至关重要。
多组学融合: 现代测序仪不仅测 DNA,还是 单细胞测序空间转录组(如 Stereo-seq)的信号读取终端。

       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Bentley DR, et al. (2008). Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry. Nature.
[点评]:Illumina (Solexa) 技术的奠基之作,详细描述了 SBS 测序原理,开启了二代测序的统治时代。

[2] Goodwin S, McPherson JD, McCombie WR. (2016). Coming of age: ten years of next-generation sequencing technologies. Nature Reviews Genetics.
[点评]:全面综述了 NGS 技术的十年发展历程,对比了 Illumina、PacBio 和 Nanopore 的优劣。

[3] Drmanac R, et al. (2010). Human genome sequencing using unchained base reads on self-assembling DNA nanoarrays. Science.
[点评]:Complete Genomics (华大智造前身) 的核心论文,展示了 DNBSEQ 技术的高准确性和低成本潜力。

           测序技术生态 · 知识图谱
上级学科 生物技术基因组学
核心厂商 Illumina (NovaSeq) • 华大智造 (DNBSEQ-T7) • PacBio (Revio)
关键耗材 流动槽 (Flow Cell) • 测序试剂盒 • 文库制备试剂