100,000 Genomes Project
100,000 Genomes Project（十万基因组计划）是英国政府于 2012 年底启动、由 Genomics England (GeL) 负责执行的一项具有里程碑意义的科学与医疗计划。该计划的目标是对英国国民医疗服务体系 (NHS) 中的 85,000 名参与者（主要是Rare Diseases (罕见病) 患者及其家属，以及 Cancer (癌症) 患者）进行 100,000 例 WGS (全基因组测序)。该项目于 2018 年 12 月正式完成了测序目标。它不仅显著提高了罕见病的诊断率，更重要的是促成了全球首个将全基因组测序整合为常规临床护理的国家级服务体系——NHS Genomic Medicine Service 的诞生。
双重使命：临床与科研
100,000 Genomes Project 的设计非常独特，它既是一个科研项目，又是一个临床转型项目。
1. 临床转型 (Transformation)
在项目启动前，基因检测在 NHS 中是零散的。该项目建立了 13 个 Genomic Medicine Centres (GMCs)，为全基因组测序建立了标准化的采样、物流和分析流程，证明了在国家医疗体系中大规模应用 WGS 是可行的。
2. 科研发现 (Discovery)
通过对疑难杂症患者进行测序，项目旨在发现新的致病基因。
策略：
● 罕见病： 采用“三人组”策略 (Trio Sequencing)，即测序患者及其父母，以发现新生突变 (De novo mutations)。
● 癌症： 对比肿瘤组织和正常血液样本，寻找驱动突变。
成果与遗产：从 100K 到 500 万
| 成果维度 | 具体影响 |
|---|---|
| 诊断率提升 | 对于之前常规检测阴性的罕见病患者，WGS 提供了约 25% 的额外诊断率。 |
| 制度遗产 | 直接催生了 NHS Genomic Medicine Service (GMS)，使英国成为世界上第一个将 WGS 作为标准医疗服务的国家。 |
| 数据资产 | 建立了 National Genomic Research Library (NGRL)，这是一个拥有数十万基因组及关联临床数据的宝库。 |
数据安全：阅览室模式
为了解决隐私担忧，Genomics England 采用了一种创新的“可信研究环境” (Trusted Research Environment, TRE) 模式。
- Reading Library (阅览室) vs. Lending Library (借阅室)： 数据（全基因组序列 + 临床记录）永远不会离开 GeL 的安全服务器。研究人员必须申请账号，进入安全环境内进行分析，只能带走分析结果，不能下载原始数据。
- Airlock System (气闸系统)： 任何导出的数据必须经过人工审核，确保不包含个人识别信息。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] The 100,000 Genomes Project Pilot Investigators. (2021). 100,000 Genomes Project: Diagnosing Rare Diseases in Health Care. New England Journal of Medicine.
[点评]：里程碑式论文，详细报告了该项目在罕见病诊断方面的临床效用，证明了 WGS 在医疗体系中的价值。
[2] Turnbull C, et al. (2018). The 100,000 Genomes Project: bringing whole genome sequencing to the NHS. BMJ.
[点评]：概述了该项目的组织架构、数据模型以及将基因组学整合到常规 NHS 护理中的挑战。
[3] Caulfield T, et al. (2019). National genome projects: public trust and efficacy. Genome Medicine.
[点评]：分析了包括英国 100k 项目在内的国家级计划，重点讨论了公众信任和数据伦理管理的重要性。