SRSF1

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SRSF1(Serine and Arginine Rich Splicing Factor 1),曾用名 SF2/ASF,是 SR 蛋白家族中最具代表性的成员,也是真核细胞中至关重要的剪接因子。它通过结合前体 mRNA 上的外显子剪接增强子(ESE),招募 U1 snRNP,促进特定外显子的包含。在肿瘤生物学中,SRSF1 被定义为一个独特的“剪接原癌基因”。它在多种实体瘤(如乳腺癌肺癌)中异常高表达,通过操纵关键基因(特别是 BCL2L1)的剪接方向,促使产生抗凋亡异构体(如 Bcl-xL),从而驱动肿瘤的恶性转化和耐药性。此外,SRSF1 还参与 mRNA 的核输出、稳定性和翻译调控。

SRSF1
Splicing Factor 2 / ASF (点击展开)
               [Image:SRSF1_protein_structure_RRM_RS]
结构:RRM 识别 RNA,RS 招募蛋白
基础遗传学参数
基因符号 SRSF1
曾用名 SF2, ASF, SFRS1
染色体定位 17q22 (常扩增)
UniProt ID Q07955
蛋白结构域 (Domains)
氨基酸数 248 aa
RRM1 aa 11-92 (RNA结合核心)
RRM2 (Zn) aa 118-196 (锌指状结构)
RS Domain C端 (富含Arg/Ser,磷酸化位点)
功能网络
结合元件 ESE (外显子剪接增强子)
拮抗因子 hnRNP A1
上游激酶 SRPK1, CLK1
亚细胞定位 核斑 (Nuclear Speckles), 胞质(穿梭)
临床病理
关键靶基因 BCL2L1 (Bcl-xL), RON, MKNK2
疾病角色 原癌基因 (Oncogene)
PDB 结构 1X4A, 4I9F

分子机制:剪接的“定义者”

SRSF1 的功能依赖于其双重结构特征:利用 N 端的 RRM 结构域识别 RNA,利用 C 端的 RS 结构域进行蛋白-蛋白相互作用。

  • ESE 结合与外显子定义:
    SRSF1 特异性结合外显子上的ESE(Exonic Splicing Enhancer)序列。结合后,它通过 RS 结构域招募剪接体组分 U1 snRNP 到上游的 5' 剪接位点,并辅助 U2AF 结合 3' 剪接位点。这一过程稳定了外显子定义,促进了该外显子的包含(Inclusion)。
  • 与 hnRNP A1 的拮抗:
    细胞内的剪接决定往往取决于 SRSF1 和 hnRNP A1 的浓度比。SRSF1 促进外显子包含,而 hnRNP A1 促进外显子跳跃(Skipping)。这种平衡在肿瘤中常被打破(SRSF1 升高)。
  • 磷酸化循环 (Shuttling):
    SRSF1 的核质穿梭受磷酸化严格调控。胞质中的 SRPK1 激酶磷酸化 SRSF1,使其入核;核内的 CLK1 激酶进一步修饰其 RS 结构域,使其参与剪接复合物组装。

致癌机制:Bcl-xL 的幕后推手

BCL2L1 剪接开关

SRSF1 是决定 BCL2L1 基因命运的关键因子。SRSF1 结合在 BCL2L1 的外显子 2 区域,促进远端 5' 剪接位点的使用,从而生成长型的抗凋亡蛋白 Bcl-xL,并抑制促凋亡蛋白 Bcl-xS 的生成。在 SRSF1 高表达的肿瘤中,这一机制是导致化疗耐药的核心原因。

   [Image:SRSF1_mediated_splicing_BCL2L1]
靶基因 正常异构体 (低SRSF1) 致癌异构体 (高SRSF1)
BCL2L1 Bcl-xS (促凋亡) Bcl-xL (抗凋亡)
MKNK2 Mnk2a (抑癌) Mnk2b (促Ras信号)
MST1R (Ron) Ron (常规) ΔRon (高侵袭性)

治疗前沿:靶向剪接机器

  • SRPK 抑制剂:
    药物如 SRPIN340 抑制上游激酶 SRPK1,阻止 SRSF1 的磷酸化和入核,从而纠正异常剪接。
  • 剪接转换寡核苷酸 (SSO):
    反义技术。设计与 SRSF1 结合位点互补的寡核苷酸,空间位阻 SRSF1 与前体 mRNA 的结合,强迫细胞生成抗肿瘤异构体(如 Bcl-xS)。
       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Karni R, et al. (2007). The gene encoding the splicing factor SF2/ASF is a proto-oncogene. Nature Structural & Molecular Biology.
[点评]:里程碑式研究,首次将 SRSF1 定义为原癌基因,证明其轻微过表达即足以诱导细胞癌变。

[2] Anczuków O, et al. (2012). The splicing factor SRSF1 regulates apoptosis and proliferation to promote mammary epithelial cell transformation. Nature Structural & Molecular Biology.
[点评]:详细解析了 SRSF1 通过调控 BCL2L1 和 BIN1 等基因的剪接来促进乳腺癌发生的分子机制。

[3] Das S, Krainer AR. (2014). Emerging functions of SRSF1, splicing factor and oncoprotein, in RNA metabolism and cancer. Molecular Cancer Research.
[点评]:由该领域泰斗 Krainer 撰写的综述,全面总结了 SRSF1 在剪接之外的多重功能(如翻译控制和 mRNA 稳定)。

           SRSF1 · 知识图谱
上游调控 SRPK1 (磷酸化) • CLK1Myc (转录激活)
下游靶点 Bcl-xL (抗凋亡) • Ron (侵袭) • MKNK2Rac1
拮抗关系 hnRNP A1 (促外显子跳跃) • Sam68
临床应用 SRPK抑制剂剪接调节剂乳腺癌标志物