ARID1A

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ARID1A(AT-Rich Interaction Domain 1A),编码 BAF250a 蛋白,是 SWI/SNF(mSWI/SNF 或 BAF)ATP 依赖性染色质重塑复合物中最大的特异性亚基。作为一种典型的肿瘤抑制基因,ARID1A 负责引导 SWI/SNF 复合物结合到特定的染色质区域,调节基因的可及性(Chromatin Accessibility),从而控制转录、DNA 修复和细胞分化。ARID1A 是人类癌症中突变频率最高的染色质调节基因之一,其功能丧失性突变(Loss-of-Function)在卵巢透明细胞癌 (OCCC)子宫内膜样癌中尤为普遍(>50%),并与微卫星不稳定性(MSI)及子宫内膜异位症恶变密切相关。

ARID1A · 基因档案
Gene & Protein Profile (点击展开)
染色质重塑因子 / 抑癌基因
基因符号 ARID1A
常用别名 BAF250a, SMARCF1, OSA1
编码蛋白 AT-rich interactive domain-containing protein 1A
染色体位置 1p36.11
Entrez ID 8289
HGNC ID 11110
UniProt O14497
分子量 ~242 kDa
功能分类 SWI/SNF 复合物亚基

分子机制:染色质重塑与表观拮抗

ARID1A 通过复杂的表观遗传网络维持基因组的稳定性,其核心机制涉及与 PRC2 复合物的拮抗作用:

  • SWI/SNF 复合物组装: ARID1A 通过其 C 端与 SWI/SNF 的核心 ATP 酶亚基(SMARCA4/BRG1 或 SMARCA2/BRM)相互作用。它通过 ARID 结构域识别富含 AT 的 DNA 序列,将复合物锚定到启动子和增强子区域,利用 ATP 能量“滑移”或“驱逐”核小体,使染色质处于开放状态,利于转录因子结合。
  • SWI/SNF vs PRC2 拮抗 (Epigenetic Antagonism): 正常情况下,SWI/SNF(激活型)与 PRC2(抑制型,含 EZH2)相互制衡。ARID1A 的缺失打破了这种平衡,导致 PRC2 活性相对过剩,H3K27me3 水平升高,抑癌基因(如 PIK3IP1)被异常沉默,从而激活 PI3K/AKT 等促癌通路。
  • DNA 修复缺陷: ARID1A 参与招募 DNA 错配修复(MMR)蛋白和双链断裂修复蛋白。ARID1A 缺失会导致基因组不稳定,常表现为微卫星不稳定性(MSI-High)。

临床景观:妇科肿瘤的特征性驱动

ARID1A 的突变谱具有鲜明的组织特异性,是卵巢透明细胞癌和子宫内膜异位症相关恶性肿瘤的标志。

疾病类型 突变频率 临床病理特征
卵巢透明细胞癌 (OCCC) 46% - 57% ARID1A 突变是 OCCC 的早期驱动事件。它常在非典型子宫内膜异位症(癌前病变)中即已存在,支持了“子宫内膜异位症-透明细胞癌”的转化模型。
子宫内膜样癌 ~40% 常与 PTEN、PIK3CA 突变及 MSI 共存。ARID1A 缺失通常导致 BAF250a 蛋白表达完全丧失(IHC 检测阴性)。
胃癌 ~10-25% 特别是 EBV 阳性胃癌和 MSI-H 胃癌。ARID1A 突变与较差的预后和化疗耐药相关。
胆道癌 ~15% 常见的突变基因之一,常作为二代测序(NGS)检测面板的常规项目。

治疗策略:合成致死 (Synthetic Lethality)

由于 ARID1A 突变导致的是功能缺失(难以直接靶向恢复),目前的策略集中在利用其缺失造成的特定脆弱性进行合成致死打击。

  • EZH2 抑制剂:Tazemetostat
    *原理:ARID1A 缺失导致细胞对 PRC2(EZH2)的抑制高度依赖。阻断 EZH2 可特异性诱导 ARID1A 突变细胞死亡,而不影响正常细胞。多项临床试验正在妇科肿瘤中评估此策略。
  • ATR 抑制剂:
    ARID1A 缺失导致细胞处于复制压力和 DNA 损伤修复缺陷状态,使其极度依赖 ATR 激酶来维持生存。ATR 抑制剂在 ARID1A 缺陷模型中显示出显著疗效。
  • PARP 抑制剂:
    由于 ARID1A 参与同源重组修复调节,其缺失可能产生类似“BRCAness”的表型,使得肿瘤对 PARP 抑制剂敏感。
  • 免疫治疗 (PD-1/PD-L1):
    ARID1A 突变常与微卫星不稳定性(MSI-High)和高肿瘤突变负荷(TMB)相关,这类患者通常对免疫检查点抑制剂响应良好。

关键关联概念

  • SWI/SNF 复合物: 哺乳动物中也称为 BAF 复合物,ARID1A 是其核心识别亚基。
  • 合成致死: 针对 ARID1A 缺失肿瘤的核心治疗逻辑(如联合 EZH2 抑制)。
  • 子宫内膜异位症: ARID1A 突变是连接内异症与卵巢癌的关键分子桥梁。
  • BAF250a: ARID1A 编码的蛋白,病理科通过 IHC 检测该蛋白的核缺失来辅助诊断。
       学术参考文献与权威点评
       

[1] Jones S, et al. (2010). Frequent mutations of chromatin remodeling gene ARID1A in ovarian clear cell carcinoma. Science.
[学术点评]:里程碑文献。与 Wiegand 等人同期发表,首次利用全 外显子组测序发现 ARID1A 在卵巢透明细胞癌中的高频突变,将其确立为该亚型的特征性驱动基因。

[2] Wiegand KC, et al. (2010). ARID1A mutations in endometriosis-associated ovarian carcinomas. New England Journal of Medicine (NEJM).
[学术点评]:临床转化关键。证实了 ARID1A 突变存在于子宫内膜异位症病灶中,为内异症恶变为透明细胞癌提供了分子遗传学证据。

[3] Bitler BG, et al. (2015). Synthetic lethality by targeting EZH2 methyltransferase activity in ARID1A-mutated cancers. Nature Medicine.
[学术点评]:治疗策略奠基。揭示了 ARID1A 与 EZH2 的拮抗关系,并证明了 EZH2 抑制剂在 ARID1A 突变肿瘤中的合成致死效应,开启了相关临床试验。

[4] Kadoch C, et al. (2013). Proteomic and bioinformatic analysis of mammalian SWI/SNF complexes identifies extensive roles in human malignancy. Nature Genetics.
[学术点评]:系统性综述。指出 SWI/SNF 复合物亚基突变涉及约 20% 的人类癌症,确立了该复合物作为一大类肿瘤抑制因子的地位。

[5] Shen J, et al. (2018). ARID1A deficiency promotes mutability and potentiates therapeutic antitumor immunity unleashed by immune checkpoint blockade. Nature Medicine.
[学术点评]:免疫治疗关联。发现 ARID1A 缺失通过破坏错配修复(MMR)增加突变负荷,从而使肿瘤对 PD-L1 阻断治疗敏感。