肿瘤基因检测

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肿瘤基因检测
肿瘤组织与液体活检的基因分析流程
检测对象 体细胞突变 / 胚系突变
核心技术 NGS, qPCR, Sanger, FISH
样本类型 组织 (FFPE) / 血液 (ctDNA)
临床价值 伴随诊断、预后、筛查

肿瘤基因检测是通过分子生物学手段检测肿瘤细胞内的遗传物质(DNA/RNA)改变的技术。其核心目的是识别驱动肿瘤生长的关键基因变异,为临床精准选择靶向药物、免疫治疗、评估预后及遗传风险提供科学依据。

目前,肿瘤基因检测已从单基因检测(Hotspot Testing)全面转向基于二代测序(NGS)的大面板(Panel)或全外显子组(WES)分析。

检测维度与生物学标志物

肿瘤基因检测不仅关注单一的碱基替换,还涵盖了更复杂的基因组变异。


   样本采集
   
   文库构建与测序
   
   生物信息学分析
   
   报告解读 (MDT)

核心临床应用场景

肿瘤基因检测在不同阶段的应用
应用场景 核心目标 代表性标志物
伴随诊断 筛选靶向药物获益人群 KRAS (肺癌/结直肠癌)、EGFR
免疫治疗方案 预测免疫检查点抑制剂疗效 MSI/dMMR、TMB、PD-L1
预后与复发监测 评估术后风险、微小残留病灶 MRD 监测 (ctDNA)
遗传风险评估 筛查家族性遗传性肿瘤 BRCA1/BRCA2 (乳腺癌/卵巢癌)

技术客观评估

在临床实践中,不同技术平台各具优劣: 1. **qPCR (定量PCR)**:

   * **优点**:速度快(1-2天)、成本低、灵敏度高。
   * **缺点**:通量极低,只能检测已知位点,无法发现新突变或复杂融合。

2. **NGS (二代测序)**:

   * **优点**:一次性检测成百上千个基因;可计算 TMB、MSI 等复合指标;适合未知融合检测。
   * **缺点**:成本较高、周期较长(通常7-14天)、对生物信息学解读要求高。

3. **FISH (荧光原位杂交)**:

   * **适用**:基因扩增(如 HER2)和易位(如 ALK)检测的金标准,但无法提供碱基维度的信息。

样本类型的实话实说

  • **组织检测 (Gold Standard)**:直接来自肿瘤,突变信息最丰富、最准确。局限性在于组织获取困难(需穿刺或手术)且存在异质性。
  • **液体活检 (Liquid Biopsy)**:通过血液中的 ctDNA 进行检测。**实话实说**:它解决了取样难题,适合动态监测,但灵敏度受限,若结果阴性通常仍需组织检测确认,不能完全替代组织活检[1]

参考文献

  1. Merker JD, et al. Circulating Tumor DNA Analysis in Patients With Cancer: ASCO and CAP Joint Review. Journal of Clinical Oncology. 2018.
肿瘤精准医疗技术导航
核心靶点 KRASEGFRALKBRAFHER2
综合指标 TMB (肿瘤突变负荷) • MSI (微卫星不稳定性) • MRD
治疗关联 靶向治疗免疫治疗HLA配型新抗原疫苗