“MHC亲和力”的版本间的差异

来自医学百科
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<div class="medical-infobox" style="font-size: 0.85em; width: 280px; float: right; margin: 0 0 1em 1em; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; background: #fff; box-shadow: 0 4px 6px -1px rgba(0,0,0,0.1);">
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|+ style="font-size: 1.3em; font-weight: bold; padding: 15px 10px 5px 10px; color: #1a202c; text-align: center;" | MHC 亲和力<br><span style="font-size: 0.8em; color: #64748b; font-weight: normal;">(MHC Affinity)</span>
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|+ style="font-size: 1.3em; font-weight: bold; padding: 18px 10px 10px 10px; color: #1a202c; text-align: center; line-height: 1.2;" | MHC 亲和力<br><span style="font-size: 0.75em; color: #64748b; font-weight: normal; text-transform: uppercase;">MHC Binding Affinity</span>
 
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     <div style="font-size: 0.8em; color: #94a3b8; margin-top: 12px; font-weight: normal; line-height: 1.4;">肽段-MHC (pMHC)<br>复合体结合动力学示意图</div>
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     <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; font-weight: normal; line-height: 1.4;">肽段-MHC (pMHC)<br>复合体结合结构示意</div>
 
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! style="text-align: left; padding: 10px 0 10px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 核心定义
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! style="text-align: left; padding: 12px 0 10px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 核心定义
| style="padding: 10px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; font-weight: 600; text-align: right;" | 抗原肽与MHC结合强度
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| style="padding: 12px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; font-weight: 600; text-align: right; color: #1e293b;" | 肽段与MHC槽口结合强度
 
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! style="text-align: left; padding: 10px 0 10px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 量化指标
| style="padding: 10px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right;" | IC<sub>50</sub> (nM), %Rank
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| style="padding: 10px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right; color: #1e293b;" | IC<sub>50</sub> (nM), %Rank
 
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! style="text-align: left; padding: 10px 0 10px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 判定阈值
| style="padding: 10px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right;" | 强结合 < 50nM<br>弱结合 < 500nM
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| style="padding: 10px 15px 15px 0; text-align: right;" | [[新抗原筛选]]<br>免疫原性评估
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| style="padding: 10px 15px 18px 0; text-align: right; color: #1e293b; line-height: 1.4;" | [[新抗原筛选]]<br>免疫原性评估
 
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'''MHC亲和力'''(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 [[HLA分型|HLA]])分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。
 
'''MHC亲和力'''(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 [[HLA分型|HLA]])分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。
  
在免疫学研究中,MHC 亲和力通常以半最大抑制浓度(IC<sub>50</sub>)来量化。IC<sub>50</sub> 值越小,代表亲和力越高。高效的 MHC 结合是[[新抗原疫苗]]和[[细胞治疗]]靶点筛选的首要门槛。
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在免疫学研究中,MHC 亲和力通常以半最大抑制浓度(IC<sub>50</sub>)来量化。IC<sub>50</sub> 值越小,代表亲和力越高。高效的 MHC 结合是[[新抗原疫苗]]和[[细胞治疗]]靶点筛选的首要门槛,因为只有与 MHC 分子具有足够亲和力的肽段,才能在细胞表面稳定表达并诱导有效的 T 细胞杀伤。
  
 
== 生理学基础与量化 ==
 
== 生理学基础与量化 ==
 
MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。
 
MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。
  
* **量化指标**:亲和力通常通过竞争性实验测定。
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* **量化公式**:亲和力通常通过竞争性实验测定,并在计算生物学中利用回归模型进行预测。
* **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的结合偏好不同,现代算法引入了 %Rank 值。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
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* **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的等位基因频率和结合偏好不同,现代算法(如 NetMHCpan)引入了 %Rank 值,即该肽段在大量随机序列中的相对排名。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
  
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     <span style="font-family: sans-serif; font-size: 1.05em; font-weight: bold; color: #2563eb;">抗原加工与修剪</span>
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     <span style="font-size: 1.0em; font-weight: bold; color: #2563eb;">抗原加工/修剪</span>
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== 临床特征客观评估 ==
 
== 临床特征客观评估 ==
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基于目前精准免疫学及生物信息学的标准,MHC 亲和力的技术应用特征分析如下。
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|+ style="font-weight: bold; font-size: 1.1em; margin-bottom: 12px; color: #2c3e50; text-align: center;" | MHC 亲和力预测与评估特征分析
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<div style="overflow-x: auto; width: 95%; margin: 20px auto;">
|- style="background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 2px solid #e2e8f0;"
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{| class="wikitable" style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: none; font-size: 0.9em; background-color: #fff; line-height: 1.5;"
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; width: 20%;" | 评估维度
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|+ style="font-weight: bold; margin-bottom: 10px; color: #334155; text-align: center;" | MHC 亲和力预测技术特征
! style="text-align: left; padding: 12px 15px;" | 临床客观表现与技术特征
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|- style="background-color: #f1f5f9; color: #475569;"
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
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! style="padding: 10px; width: 25%; border: 1px solid #e2e8f0;" | 评估维度
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 算法预测能力
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! style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | 技术特征与临床表现
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 基于神经网络的算法(如 NetMHCpan-4.1)能实现跨分型预测。高亲和力仅是新抗原成立的必要非充分条件。
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | I类与II类差异
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 稳定性 (Stability)
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | MHC-I 结合 8-11 氨基酸(槽口闭合);MHC-II 结合 13-25 氨基酸(槽口开放)。I 类预测成熟度更高。
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 较之瞬时亲和力,pMHC 复合体在细胞表面的半衰期对 T 细胞激活更具价值。实验测定的解离常数 k<sub>off</sub> 是评估关键。
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 算法预测能力
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | NetMHCpan-4.1 可实现跨分型预测。需注意高亲和力是新抗原成立的必要非充分条件。
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 稳定性 (Stability)
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | pMHC 复合体表面半衰期对 T 细胞激活更具预测价值。实验测定的解离常数 k<sub>off</sub> 是关键指标。
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 突变回避/交叉
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | 评估突变肽与野生型亲和力差异(Agretopicity)是识别有效新抗原的核心逻辑。
 
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== 技术关联与应用 ==
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* **[[新抗原筛选]] (Neoantigen Screening)**:通过预测候选肽段与患者个人 [[HLA分型]] 的亲和力,排除无效突变。
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* **[[HLA分型]] (HLA Typing)**:预测精准度高度依赖于 HLA 等位基因的精确识别。
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* **[[质谱免疫组]] (Immunopeptidomics)**:通过 LC-MS/MS 直接鉴定洗脱肽段,为算法提供金标准训练数据。
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== 参考文献 ==
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* [1] Nielsen M, et al. NetMHCpan-4.0: Improved Prediction of MHC Antigen Presentation. J Immunol, 2017.
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* [2] Sanchez-Trincado JL, et al. T- and B-cell epitope prediction. J Immunol Res, 2017.
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* [3] Wells DK, et al. Key Parameters of Tumor Epitope Immunogenicity. Cancer Cell, 2020.
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<div style="background-color: #e2e8f0; text-align: center; font-weight: bold; padding: 8px; color: #475569; font-size: 0.9em;">肿瘤免疫学与生物信息预测导航</div>
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| style="padding: 8px;" | [[新抗原疫苗]] • [[TCR-T治疗]] • [[TIL疗法]]
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[[Category:免疫学]] [[Category:生物信息学]] [[Category:肿瘤学]]

2025年12月25日 (四) 10:05的版本

MHC 亲和力
MHC Binding Affinity
肽段-MHC (pMHC)
复合体结合结构示意
核心定义 肽段与MHC槽口结合强度
量化指标 IC50 (nM), %Rank
判定阈值 强结合 < 50nM
弱结合 < 500nM
临床意义 新抗原筛选
免疫原性评估

MHC亲和力(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 HLA)分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。


在免疫学研究中,MHC 亲和力通常以半最大抑制浓度(IC50)来量化。IC50 值越小,代表亲和力越高。高效的 MHC 结合是新抗原疫苗细胞治疗靶点筛选的首要门槛,因为只有与 MHC 分子具有足够亲和力的肽段,才能在细胞表面稳定表达并诱导有效的 T 细胞杀伤。

生理学基础与量化

MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。

  • **量化公式**:亲和力通常通过竞争性实验测定,并在计算生物学中利用回归模型进行预测。
  • **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的等位基因频率和结合偏好不同,现代算法(如 NetMHCpan)引入了 %Rank 值,即该肽段在大量随机序列中的相对排名。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
   抗原加工/修剪
   
   MHC 亲和力筛选
   
   TCR 识别/激活

临床特征客观评估

基于目前精准免疫学及生物信息学的标准,MHC 亲和力的技术应用特征分析如下。

MHC 亲和力预测技术特征
评估维度 技术特征与临床表现
I类与II类差异 MHC-I 结合 8-11 氨基酸(槽口闭合);MHC-II 结合 13-25 氨基酸(槽口开放)。I 类预测成熟度更高。
算法预测能力 NetMHCpan-4.1 可实现跨分型预测。需注意高亲和力是新抗原成立的必要非充分条件。
稳定性 (Stability) pMHC 复合体表面半衰期对 T 细胞激活更具预测价值。实验测定的解离常数 koff 是关键指标。
突变回避/交叉 评估突变肽与野生型亲和力差异(Agretopicity)是识别有效新抗原的核心逻辑。

技术关联与应用

  • **新抗原筛选 (Neoantigen Screening)**:通过预测候选肽段与患者个人 HLA分型 的亲和力,排除无效突变。
  • **HLA分型 (HLA Typing)**:预测精准度高度依赖于 HLA 等位基因的精确识别。
  • **质谱免疫组 (Immunopeptidomics)**:通过 LC-MS/MS 直接鉴定洗脱肽段,为算法提供金标准训练数据。

参考文献

  • [1] Nielsen M, et al. NetMHCpan-4.0: Improved Prediction of MHC Antigen Presentation. J Immunol, 2017.
  • [2] Sanchez-Trincado JL, et al. T- and B-cell epitope prediction. J Immunol Res, 2017.
  • [3] Wells DK, et al. Key Parameters of Tumor Epitope Immunogenicity. Cancer Cell, 2020.
肿瘤免疫学与生物信息预测导航
预测指标 IC50%Rank半衰期Agretopicity
核心技术 HLA分型新抗原筛选质谱免疫组
治疗关联 新抗原疫苗TCR-T治疗TIL疗法