“HLA配型”的版本间的差异
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| − | |+ style="font-size: 1.25em; font-weight: bold; margin-bottom: 12px; color: #2c3e50;" | HLA | + | |+ style="font-size: 1.25em; font-weight: bold; margin-bottom: 12px; color: #2c3e50;" | HLA 分型技术演变 |
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| − | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | | + | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | 第一代 |
| − | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; font-weight: 600;" | | + | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; font-weight: 600;" | 血清学 / 细胞学 |
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| − | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | | + | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | 第二代 |
| − | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6;" | | + | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6;" | PCR-SSP / PCR-SSO |
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| − | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | | + | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6; color: #4b5563;" | 第三代 (金标准) |
| − | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6;" | | + | | style="padding: 10px 0; border-bottom: 1px solid #f3f4f6;" | SBT (Sanger 测序) |
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| − | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; color: #4b5563;" | | + | ! style="text-align: left; padding: 10px 0; color: #4b5563;" | 最新一代 |
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| − | '''HLA | + | '''HLA 检测技术演进'''反映了临床医学对免疫识别精度需求的不断提升。从早期的仅能区分抗原类别(低分辨),发展到如今能精确读取碱基序列(高分辨),技术的迭代直接提高了器官移植的存活率和肿瘤免疫治疗的有效性。 |
| + | 目前,临床上根据需求不同,通过低、中、高三种分辨率的手段并存,但 NGS 技术正逐渐成为精准医疗的主流选择。 | ||
| + | == 技术迭代路线图 == | ||
| + | HLA 分型技术经历了从蛋白质水平到基因水平,再到全基因组水平的三个阶段: | ||
| − | + | <div style="text-align: center; margin: 30px 0; padding: 15px; background: #fdfdfd; border-top: 1px solid #eee; border-bottom: 1px solid #eee;"> | |
| + | <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; color: #64748b;">血清学 (CDC)</span> | ||
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| + | <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; color: #d97706;">PCR 分子法 (SSP/SSO)</span> | ||
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| + | <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; color: #059669;">SBT 测序</span> | ||
| + | <span style="margin: 0 10px; color: #cbd5e1; font-size: 1.3em;">→</span> | ||
| + | <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; font-weight: bold; color: #2563eb;">NGS 全长测序</span> | ||
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| + | == 各阶段技术客观评价 == | ||
| − | == | + | === 1. 血清学与细胞学方法 (已淘汰/辅助用) === |
| − | HLA | + | 早期主要利用微量淋巴细胞毒试验 (CDC)。 |
| + | * '''原理''':利用抗原-抗体反应来判断 HLA 类型。 | ||
| + | * '''局限''':只能达到“低分辨”水平(2位数字),无法区分基因亚型,且需要活细胞,样本保存困难。目前主要用于移植前的最终交叉配型,而非定型。 | ||
| − | + | === 2. PCR 分子生物学方法 (SSP/SSO) === | |
| − | + | 随着 PCR 技术的普及,基于 DNA 的分型成为主流。 | |
| − | + | * '''PCR-SSP''' (序列特异性引物):引物特异性扩增,扩增出来即阳性。速度极快,适合急诊器官移植(如尸体肾移植)。 | |
| − | + | * '''PCR-SSO''' (序列特异性寡核苷酸探针):适合大规模样本初筛(如骨髓库入库)。 | |
| − | + | * '''客观评价''':虽然比血清学准,但通常只能达到“中低分辨”,无法解决相位模糊(Phase Ambiguity)问题。 | |
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| + | === 3. SBT 直接测序法 (曾经的金标准) === | ||
| + | 基于 Sanger 测序原理的 Sequence-Based Typing。 | ||
| + | * '''优势''':可以直接读取外显子序列,达到“高分辨”(4位数字)。 | ||
| + | * '''缺陷''':由于 Sanger 测序读长限制,且双链同时测序,常常出现“模棱两可”的碱基读取,需要依靠软件推测,无法覆盖内含子信息。 | ||
| + | === 4. NGS 高通量测序 (当前前沿) === | ||
| + | 利用边合成边测序(SBS)或单分子测序技术。 | ||
| + | * '''优势''': | ||
| + | ** '''超高分辨''':可提供 6-8 位甚至全基因组序列。 | ||
| + | ** '''全覆盖''':覆盖全长基因(含内含子和非翻译区),彻底解决了等位基因模棱两可的问题。 | ||
| + | ** '''通量大''':一次可检测数千个样本。 | ||
| + | * '''挑战''':实验周期相对 PCR 方法较长,数据分析对生物信息学算法要求极高<ref>Hosomichi K, et al. The impact of next-generation sequencing technologies on HLA research and diagnostics. Journal of Human Genetics. 2015.</ref>。 | ||
| − | == | + | == 技术参数对比 == |
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| − | |+ HLA | + | |+ 主流 HLA 分型技术客观参数对比 |
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| − | ! style="background: #f8f9fa;" | | + | ! style="background: #f8f9fa;" | 技术指标 !! PCR-SSP !! PCR-SBT !! NGS |
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| − | | ''' | + | | '''分辨率''' || 低-中分辨 (2位) || 高分辨 (4位) || 超高分辨 (6-8位) |
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| − | | ''' | + | | '''检测通量''' || 低 (单样本) || 中 || 极高 |
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| − | | ''' | + | | '''相位模糊''' || 无法解决 || 部分存在 || '''彻底解决''' |
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| − | | ''' | + | | '''适用场景''' || 急诊移植配型 || 常规临床确诊 || 骨髓库详查、肿瘤疫苗研发 |
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== 参考文献 == | == 参考文献 == | ||
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| − | <div style="background-color: #dee2e6; text-align: center; font-weight: bold; padding: 6px; border-bottom: 1px solid #a2a9b1; color: #374151;"> | + | <div style="background-color: #dee2e6; text-align: center; font-weight: bold; padding: 6px; border-bottom: 1px solid #a2a9b1; color: #374151;">分子诊断技术导航</div> |
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| − | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | | + | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 基础技术 |
| − | | style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[ | + | | style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[PCR]] • [[Sanger测序]] • [[电泳]] • [[探针杂交]] |
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| − | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | | + | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 高通量技术 |
| − | | style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[ | + | | style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[NGS]] • [[全外显子测序]] • [[单细胞测序]] |
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| − | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right;" | | + | ! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right;" | 应用场景 |
| − | | style="padding: 8px;" | [[ | + | | style="padding: 8px;" | [[HLA配型]] • [[肿瘤基因检测]] • [[伴随诊断]] |
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2025年12月24日 (三) 22:11的版本
|
从血清学到高通量测序的分辨率提升
| |
| 第一代 | 血清学 / 细胞学 |
|---|---|
| 第二代 | PCR-SSP / PCR-SSO |
| 第三代 (金标准) | SBT (Sanger 测序) |
| 最新一代 | NGS (高通量测序) |
HLA 检测技术演进反映了临床医学对免疫识别精度需求的不断提升。从早期的仅能区分抗原类别(低分辨),发展到如今能精确读取碱基序列(高分辨),技术的迭代直接提高了器官移植的存活率和肿瘤免疫治疗的有效性。
目前,临床上根据需求不同,通过低、中、高三种分辨率的手段并存,但 NGS 技术正逐渐成为精准医疗的主流选择。
技术迭代路线图
HLA 分型技术经历了从蛋白质水平到基因水平,再到全基因组水平的三个阶段:
血清学 (CDC) → PCR 分子法 (SSP/SSO) → SBT 测序 → NGS 全长测序
各阶段技术客观评价
1. 血清学与细胞学方法 (已淘汰/辅助用)
早期主要利用微量淋巴细胞毒试验 (CDC)。
- 原理:利用抗原-抗体反应来判断 HLA 类型。
- 局限:只能达到“低分辨”水平(2位数字),无法区分基因亚型,且需要活细胞,样本保存困难。目前主要用于移植前的最终交叉配型,而非定型。
2. PCR 分子生物学方法 (SSP/SSO)
随着 PCR 技术的普及,基于 DNA 的分型成为主流。
- PCR-SSP (序列特异性引物):引物特异性扩增,扩增出来即阳性。速度极快,适合急诊器官移植(如尸体肾移植)。
- PCR-SSO (序列特异性寡核苷酸探针):适合大规模样本初筛(如骨髓库入库)。
- 客观评价:虽然比血清学准,但通常只能达到“中低分辨”,无法解决相位模糊(Phase Ambiguity)问题。
3. SBT 直接测序法 (曾经的金标准)
基于 Sanger 测序原理的 Sequence-Based Typing。
- 优势:可以直接读取外显子序列,达到“高分辨”(4位数字)。
- 缺陷:由于 Sanger 测序读长限制,且双链同时测序,常常出现“模棱两可”的碱基读取,需要依靠软件推测,无法覆盖内含子信息。
4. NGS 高通量测序 (当前前沿)
利用边合成边测序(SBS)或单分子测序技术。
- 优势:
- 超高分辨:可提供 6-8 位甚至全基因组序列。
- 全覆盖:覆盖全长基因(含内含子和非翻译区),彻底解决了等位基因模棱两可的问题。
- 通量大:一次可检测数千个样本。
- 挑战:实验周期相对 PCR 方法较长,数据分析对生物信息学算法要求极高[1]。
技术参数对比
| 技术指标 | PCR-SSP | PCR-SBT | NGS |
|---|---|---|---|
| 分辨率 | 低-中分辨 (2位) | 高分辨 (4位) | 超高分辨 (6-8位) |
| 检测通量 | 低 (单样本) | 中 | 极高 |
| 相位模糊 | 无法解决 | 部分存在 | 彻底解决 |
| 适用场景 | 急诊移植配型 | 常规临床确诊 | 骨髓库详查、肿瘤疫苗研发 |
参考文献
- ↑ Hosomichi K, et al. The impact of next-generation sequencing technologies on HLA research and diagnostics. Journal of Human Genetics. 2015.