“MHC亲和力”的版本间的差异

来自医学百科
 
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     <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; font-weight: normal; line-height: 1.4;">肽段-MHC (pMHC)<br>复合体结合结构示意</div>
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     <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; font-weight: normal; line-height: 1.4;">肽段-MHC (pMHC)<br>结合动力学示意图</div>
 
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| style="padding: 12px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; font-weight: 600; text-align: right; color: #1e293b;" | 肽段与MHC槽口结合强度
 
 
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| style="padding: 0 15px 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; font-weight: 600; text-align: left; color: #1e293b;" | 肽段与MHC槽口结合强度
| style="padding: 10px 15px 10px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right; color: #1e293b;" | IC<sub>50</sub> (nM), %Rank
 
 
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'''MHC亲和力'''(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 [[HLA分型|HLA]])分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。
 
'''MHC亲和力'''(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 [[HLA分型|HLA]])分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。
  
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[Image of MHC peptide binding groove structure]
  
  
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MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。
 
MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。
  
* **量化公式**:亲和力通常通过竞争性实验测定,并在计算生物学中利用回归模型进行预测。
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* **量化公式**:亲和力通常通过竞争性实验测定,并在计算生物学中利用回归模型预测。
* **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的等位基因频率和结合偏好不同,现代算法(如 NetMHCpan)引入了 %Rank 值,即该肽段在大量随机序列中的相对排名。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
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* **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的结合偏好不同,现代算法引入了 %Rank 值。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
  
 
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基于目前精准免疫学及生物信息学的标准,MHC 亲和力的技术应用特征分析如下。
 
基于目前精准免疫学及生物信息学的标准,MHC 亲和力的技术应用特征分析如下。
  
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|+ style="font-weight: bold; margin-bottom: 10px; color: #334155; text-align: center;" | MHC 亲和力预测技术特征
 
|+ style="font-weight: bold; margin-bottom: 10px; color: #334155; text-align: center;" | MHC 亲和力预测技术特征
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! style="padding: 10px; width: 25%; border: 1px solid #e2e8f0;" | 评估维度
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! style="padding: 10px; width: 22%; border: 1px solid #e2e8f0; text-align: left;" | 评估维度
! style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | 技术特征与临床表现
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! style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0; text-align: left;" | 技术特征与临床表现
 
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | I类与II类差异
 
| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | I类与II类差异
| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | MHC-I 结合 8-11 氨基酸(槽口闭合);MHC-II 结合 13-25 氨基酸(槽口开放)。I 类预测成熟度更高。
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | MHC-I 结合 8-11 氨基酸(槽口闭合);MHC-II 结合 13-25 氨基酸(槽口开放)。
 
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 算法预测能力
 
| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 算法预测能力
| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | NetMHCpan-4.1 可实现跨分型预测。需注意高亲和力是新抗原成立的必要非充分条件。
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | 基于神经网络(如 NetMHCpan-4.1)可实现跨分型预测。高亲和力是新抗原成立的必要条件。
 
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 稳定性 (Stability)
 
| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 稳定性 (Stability)
| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | pMHC 复合体表面半衰期对 T 细胞激活更具预测价值。实验测定的解离常数 k<sub>off</sub> 是关键指标。
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| style="padding: 10px; border: 1px solid #e2e8f0;" | pMHC 复合体表面半衰期对 T 细胞激活更具预测价值。需参考解离常数 k<sub>off</sub>
 
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| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 突变回避/交叉
 
| style="padding: 10px; font-weight: 600; background-color: #fcfdfe; border: 1px solid #e2e8f0;" | 突变回避/交叉
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== 技术关联与应用 ==
 
== 技术关联与应用 ==
* **[[新抗原筛选]] (Neoantigen Screening)**:通过预测候选肽段与患者个人 [[HLA分型]] 的亲和力,排除无效突变。
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* **[[新抗原筛选]]**:通过预测候选肽段与患者个人 [[HLA分型]] 的亲和力,排除无效突变。
* **[[HLA分型]] (HLA Typing)**:预测精准度高度依赖于 HLA 等位基因的精确识别。
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* **[[质谱免疫组]]**:通过 LC-MS/MS 直接鉴定洗脱肽段,为算法提供金标准训练数据。
* **[[质谱免疫组]] (Immunopeptidomics)**:通过 LC-MS/MS 直接鉴定洗脱肽段,为算法提供金标准训练数据。
 
  
 
== 参考文献 ==
 
== 参考文献 ==
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<div style="background-color: #e2e8f0; text-align: center; font-weight: bold; padding: 8px; color: #475569; font-size: 0.9em;">肿瘤免疫学与生物信息预测导航</div>
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2025年12月25日 (四) 10:07的最新版本

MHC 亲和力
MHC Binding Affinity
肽段-MHC (pMHC)
结合动力学示意图
核心定义
肽段与MHC槽口结合强度
量化指标
IC50 (nM), %Rank
判定阈值
强结合 < 50nM;弱结合 < 500nM
临床意义
新抗原筛选、免疫原性评估

MHC亲和力(MHC Binding Affinity)是指抗原短肽与主要组织相容性复合体(MHC,在人类中称为 HLA)分子表面结合槽口之间的化学结合强度。这种结合是抗原呈递过程中的决定性步骤,直接影响 T 细胞受体(TCR)能否识别并激活免疫应答。


[Image of MHC peptide binding groove structure]


在免疫学研究中,MHC 亲和力通常以半最大抑制浓度(IC50)来量化。IC50 值越小,代表亲和力越高。高效的 MHC 结合是新抗原疫苗细胞治疗靶点筛选的首要门槛,因为只有与 MHC 分子具有足够亲和力的肽段,才能在细胞表面稳定表达并诱导有效的 T 细胞杀伤。

生理学基础与量化[编辑 | 编辑源代码]

MHC 分子的结合槽由两个 α 螺旋和一个 β 折叠底部组成,肽段通过其“锚定残基”(Anchor Residues)与槽内的特定口袋结合。

  • **量化公式**:亲和力通常通过竞争性实验测定,并在计算生物学中利用回归模型预测。
  • **%Rank 指标**:由于不同 HLA 亚型的结合偏好不同,现代算法引入了 %Rank 值。%Rank < 0.5% 通常被视为强结合。
   抗原加工/修剪
   
   MHC 亲和力筛选
   
   TCR 识别/激活

临床特征客观评估[编辑 | 编辑源代码]

基于目前精准免疫学及生物信息学的标准,MHC 亲和力的技术应用特征分析如下。

MHC 亲和力预测技术特征
评估维度 技术特征与临床表现
I类与II类差异 MHC-I 结合 8-11 氨基酸(槽口闭合);MHC-II 结合 13-25 氨基酸(槽口开放)。
算法预测能力 基于神经网络(如 NetMHCpan-4.1)可实现跨分型预测。高亲和力是新抗原成立的必要条件。
稳定性 (Stability) pMHC 复合体表面半衰期对 T 细胞激活更具预测价值。需参考解离常数 koff
突变回避/交叉 评估突变肽与野生型亲和力差异(Agretopicity)是识别有效新抗原的核心逻辑。

技术关联与应用[编辑 | 编辑源代码]

  • **新抗原筛选**:通过预测候选肽段与患者个人 HLA分型 的亲和力,排除无效突变。
  • **质谱免疫组**:通过 LC-MS/MS 直接鉴定洗脱肽段,为算法提供金标准训练数据。

参考文献[编辑 | 编辑源代码]

  • [1] Nielsen M, et al. NetMHCpan-4.0: Improved Prediction of MHC Antigen Presentation. J Immunol, 2017.
  • [2] Sanchez-Trincado JL, et al. T- and B-cell epitope prediction. J Immunol Res, 2017.
  • [3] Wells DK, et al. Key Parameters of Tumor Epitope Immunogenicity. Cancer Cell, 2020.
肿瘤免疫学与生物信息预测导航
预测指标 IC50%Rank半衰期Agretopicity
核心技术 HLA分型新抗原筛选质谱免疫组
治疗关联 新抗原疫苗TCR-T治疗TIL疗法