Protocol Exchange
Protocol Exchange 是由 Nature Portfolio（自然出版集团）维护的一个开放获取（Open Access）的在线实验方案储存库。
它旨在促进科学研究的可重复性（Reproducibility）。与同行评审期刊 Nature Protocols 不同，Protocol Exchange 允许科研人员直接上传、分享和更新他们的实验室操作规程、计算方法或临床流程。这些协议通常作为 Nature 系列期刊发表论文的补充材料存在，但拥有独立的 DOI，可被引用。它相当于实验方法学领域的“预印本”平台，是全球科研人员获取详细“手把手”实验步骤的重要资源。
姊妹篇：Exchange vs. Protocols
虽然都带有 "Nature" 和 "Protocol"，但两者定位截然不同。理解这一区别对于投稿和文献检索至关重要。
| 特性 | Protocol Exchange | Nature Protocols |
|---|---|---|
| 性质 | 存储库 (Repository)。类似预印本服务器。 | 期刊 (Journal)。高影响因子 (IF > 10)。 |
| 审核机制 | 无同行评审。仅进行基本的发布前筛查，发布速度极快。 | 严格同行评审。需验证方法的创新性、稳健性和广泛效用。 |
| 内容深度 | 灵活。可以是简单的步骤列表，也可以是针对某篇论文的特定操作细节。 | 详尽。必须包含故障排除 (Troubleshooting)、预期结果、耗时分析等。 |
| 访问权限 | 免费 (Open Access) | 订阅制 (需付费或机构权限) |
解决“材料与方法”之痛
传统论文的“Materials and Methods”部分往往受字数限制，只能简写为“如前所述（as described previously）”，导致实验难以复现。Protocol Exchange 解决了这一痛点。
- 无限细节： 允许上传详细的试剂清单、设备型号、缓冲液配方、甚至操作视频。这是实现可重复性研究的关键。
- 版本迭代： 实验技术是动态发展的。作者可以在 Protocol Exchange 上发布协议的新版本（Versioning），纠正错误或优化步骤，而不必像期刊论文那样发更正函。
- 独立引用： 每个协议都有独立的 DOI。如果你改进了一个旧方法，发布在 Protocol Exchange 上，别人使用你的改进版时可以引用该 DOI，让你获得学术承认。
关键相关概念 [Key Concepts]
1. Reproducibility Crisis (可重复性危机)： 科学界（尤其是生物医学）面临的主要挑战。Protocol Exchange 通过提供公开、详细、标准化的实验步骤，是 Nature 集团应对此危机的核心举措之一。
2. Protocols.io： Protocol Exchange 的主要竞争对手。Protocols.io 是另一个流行的开放获取协议库，以其交互性强、支持移动端和即时更新而闻名，也广泛被期刊接受。
3. Supplementary Information (补充材料)： 传统上，详细步骤放在论文的 PDF 补充材料中，难以检索。现在，越来越多的期刊鼓励将这部分内容转移到 Protocol Exchange 等结构化数据库中，以便于索引和重用。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Nature Portfolio. (2006). Protocol Exchange: About. Nature Website.
[点评]：官方定义文档。阐述了建立 Protocol Exchange 的初衷是为了建立一个开放的、社区驱动的实验方法资源库。
[2] Goodman SN, et al. (2016). What does research reproducibility mean? Sci Transl Med.
[点评]：探讨了方法学透明度（Methods Transparency）在科学研究中的核心地位，间接佐证了 Protocol Exchange 类平台的重要性。
[3] Teytelman L. (2018). No more excuses for non-reproducible methods. Nature.
[点评]：呼吁科研界放弃静态的 PDF 补充材料，转向动态的、版本可控的在线协议库（如 Protocols.io 和 Protocol Exchange）。