高通量技术
高通量技术(High-Throughput Technologies)是指利用自动化设备、精密仪器、微型化反应体系和强大的数据处理软件,在短时间内并行处理、检测和分析成千上万个生物样本或实验条件的综合技术体系。这一概念的出现标志着生物学研究从“手工作坊式”的单分子研究向“工业化”的组学研究转型。
最具代表性的应用包括基因组学中的 二代测序 (NGS) 和药物研发中的 高通量筛选 (HTS)。近年来,结合 微流控 技术的 单细胞测序 和基于 CRISPR 的全基因组筛选,更是将高通量技术推向了单细胞精度和功能基因组学的新高度。
测序革命:大规模并行测序
以 Illumina 和 MGI(华大智造)为代表的 二代测序 (NGS) 技术是高通量技术的巅峰之作。
药物研发:高通量筛选
在制药工业中,高通量筛选 (HTS) 利用自动化机器人系统,针对特定的生物靶点(如 GPCR 或 激酶),对数十万至数百万个化合物进行活性测试。
| 要素 | 描述 |
|---|---|
| 微孔板 | 从 96 孔板发展到 384 孔、1536 孔 甚至 3456 孔板。极大地减少了试剂消耗。 |
| 液体工作站 | 精密的机械臂进行移液、清洗和读板,无需人工干预。 |
| 功能基因组 | 利用 CRISPR文库 或 shRNA 文库,在细胞池(Pooled)中同时筛选上万个基因的功能,寻找耐药机制或合成致死靶点。 |
挑战:数据洪流与生物信息学
高通量技术的瓶颈已从“数据产生”转移到了“数据分析”。一次单细胞测序实验可能产生数 TB 的数据,包含数万个细胞的数万个维度的信息。
这使得 生物信息学、高性能计算 (HPC) 和 人工智能 (AI) 成为解析高通量数据的必备工具。如何从噪音中提取信号,进行多组学整合(如 ATAC+RNA),是当前的科研前沿。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Metzker ML. (2010). Sequencing technologies - the next generation. Nature Reviews Genetics.
[点评]:经典综述,详细比较了不同高通量测序平台(Illumina, Roche 454, SOLiD)的原理和应用。
[2] Macarron R, et al. (2011). Impact of high-throughput screening in biomedical research. Nature Reviews Drug Discovery.
[点评]:回顾了 HTS 技术在过去二十年中对新药发现的巨大贡献和技术演进。
[3] Regev A, et al. (2017). The Human Cell Atlas. eLife.
[点评]:标志着高通量技术进入“单细胞时代”,旨在利用单细胞测序绘制人体所有细胞类型的图谱。