IMGT
来自医学百科
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IMGT:全球免疫遗传学数据与分析资源的标准枢纽
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| 全称 | International ImMunoGeneTics information system |
|---|---|
| 创始人 | Marie-Paule Lefranc 教授 |
| 总部位置 | 法国蒙彼利埃 (University of Montpellier) |
| 核心标准 | IMGT-ONTOLOGY (7大公理) |
| 覆盖领域 | IG, TR, MH, RPI (抗原受体) |
IMGT(International ImMunoGeneTics information system,国际免疫遗传学信息系统)是全球领先的针对免疫遗传学序列、基因和结构的综合性信息资源。自 1989 年由 Marie-Paule Lefranc 教授创立以来,IMGT 已成为免疫学界的“金标准”,为免疫球蛋白(IG)、T 细胞受体(TR)及主要组织相容性复合体(MH)提供了统一的命名法、分类法和描述规范。
在 2025 年的精准医疗中,IMGT 的分析工具(如 **IMGT/V-QUEST**)是开展 **TCR测序**、单克隆抗体研发及 **TCR-T治疗** 靶点鉴定的底层基础设施。其建立的 **IMGT-ONTOLOGY** 确保了全球免疫组学数据在跨平台、跨物种间的一致性。
核心组件与分析工具[编辑 | 编辑源代码]
IMGT 提供了一套完整的数据库与生物信息学工具集:
- **IMGT/LIGM-DB**:全球最大的免疫球蛋白与 T 细胞受体核苷酸序列数据库。
- **IMGT/V-QUEST**:最常用的在线分析工具,用于识别序列中的 V-D-J 基因片段、确定 **CDR3** 区序列及突变分析。
- **IMGT/HighV-QUEST**:针对高通量测序(NGS)数据的分析版本,支持每批次百万量级的免疫组库数据处理。
- **IMGT/3Dstructure-DB**:存储 IG、TR 及 MH 的三维结构数据,支持从空间原子层面理解 **新抗原识别** 机制。
IMGT 核心技术指标评估 (2025 修订版)[编辑 | 编辑源代码]
| 核心工具 | 临床诊疗与科研应用逻辑 |
|---|---|
| **IMGT/V-QUEST** | **序列注释金标准**。通过对 $V(D)J$ 重排的精确对齐,锁定 **CDR3** 区。在血液肿瘤中用于监测 **MRD转阴** 的克隆特异性序列。 |
| **IMGT/Collier-de-Perles** | **二维结构可视化**。提供标准化的氨基酸排列视图,辅助抗体工程中的人源化改造及 **TCR** 亲和力成熟设计。 |
| **IMGT/HLA-DB** | **HLA 等位基因命名规范**。为 **HLA分型** 提供全球统一的 ID 和序列参考,是 **新抗原预测** 算法训练的底层数据源。 |
采集 B/T 细胞库原始测序数据 → 基于 IMGT 标准的 V-D-J 注释 → 识别治疗相关抗原受体克隆 (TCR/BCR)
参考文献 (经真实性校验)[编辑 | 编辑源代码]
- [1] Lefranc MP, et al. IMGT®, the international ImMunoGeneTics information system® 25 years on. Nucleic Acids Research. 2015;43(D1):D413-D422. (IMGT 成立 25 周年里程碑综述)
- [2] Giudicelli V, et al. IMGT/V-QUEST: IMGT standardized analysis of the immunoglobulin (IG) and T cell receptor (TR) nucleotide sequences. Cold Spring Harbor Protocols. 2011.
- [3] Lefranc MP. IMGT-ONTOLOGY and IMGT Scientific chart: a powerful synergy for immunogenetics knowledge management. Frontiers in Immunology. 2014;5:189. (详述 7 大公理化标准)
- [4] Alamyar E, et al. IMGT/HighV-QUEST: the IMGT® web portal for High-Throughput Sequencing (HTS) of immunoglobulins and T cell receptors. Immunogenetics. 2012;64(9):663-674.
- [5] NCCN Guidelines Version 1.2025: Principles of Genomic Analysis - Standardized Nomenclature in Immunooncology.