BioRxiv
bioRxiv（发音同 "bio-archive"）是专为生命科学领域打造的免费在线预印本服务器。
它由著名的冷泉港实验室（CSHL）于 2013 年 11 月创立，旨在效仿物理学界的 arXiv 模式，打破生物学出版周期漫长（通常需 6-12 个月）的僵局。bioRxiv 允许科研人员在稿件未经同行评审之前，将其以“预印本”形式上传，从而在 24-48 小时内向全球公开。这一平台彻底改变了生物学界的交流生态，使得“先发布，后评审”逐渐成为新的行业标准。
文化变革：从“担心被抢发”到“立贴为证”
在 bioRxiv 出现之前，生物学家极其保守，生怕在同行评审的漫长等待中被竞争对手抢先发表（Scooped）。bioRxiv 颠覆了这一逻辑。
- 优先权的确立（Priority Claim）： 上传 bioRxiv 会立即生成一个带有时间戳的 DOI。这成为了“我在这个时间点已经做出了这个发现”的铁证。如今，包括 Nature 在内的大多数顶刊都承认 bioRxiv 的发布时间为优先权时间。
- 社区反馈（Community Feedback）： 作者可以在投稿正式期刊前，先收集全球同行的评论。这些反馈往往比 2-3 个审稿人的意见更广泛、更建设性，有助于在正式投稿前完善论文。
- 职业生涯的助推器： 对于需要申请博士后、教职或基金的年轻学者，bioRxiv 允许他们在简历中列出“已完成但未正式发表”的工作。像 NIH 和 HHMI 等资助机构已正式允许在申请材料中引用预印本。
bioRxiv vs. medRxiv：界限在哪里？
虽然都是 CSHL 运营，但两者有着严格的楚河汉界，投稿时需谨慎选择。
| 特征 | bioRxiv | medRxiv |
|---|---|---|
| 核心领域 | 基础生物学。如分子生物学、神经科学、生物信息学、进化生物学。 | 临床医学。如流行病学、临床试验、公共卫生。 |
| 人类受试者 | 仅限不直接指导治疗的基础研究（如人类遗传学）。 | 涉及患者治疗、药物疗效、临床数据的研究。 |
| 筛查标准 | 检查是否为科学论文、无冒犯内容。 | 极严。检查是否会危害公共健康（如错误的用药建议）。 |
| 计算生物学 | 绝大多数投这里（如算法开发）。 | 仅限直接应用于临床数据的计算研究。 |
关键相关概念 [Key Concepts]
1. B2J (bioRxiv to Journals)： bioRxiv 的杀手级功能。作者在 bioRxiv 上传文件后，可以点击“Direct Transfer”，直接将手稿及元数据发送给 100 多家合作期刊（包括 PNAS, PLOS, eLife, Cell Press 系列等），省去了在期刊系统重新填表的繁琐。
2. Screening (初筛)： bioRxiv 的文章虽然没有同行评审，但有人工筛查。由一组被称为“Affiliates”的生物学家（通常是 PI）快速浏览，确保文章是正经的科学研究而非伪科学或纯粹的垃圾。
3. Version of Record (VoR)： 当 bioRxiv 上的预印本最终在正规期刊发表后，bioRxiv 会自动更新页面，添加指向期刊最终版本（VoR）的链接，实现学术记录的闭环。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Vale RD. (2015). Accelerating scientific publication in biology. PNAS.
[点评]：Ron Vale（HHMI 研究员）撰写的里程碑式文章。他对比了物理学（arXiv）和生物学的出版速度，强烈呼吁生物学界拥抱预印本。
[2] Sever R, et al. (2019). bioRxiv: the preprint server for biology. bioRxiv.
[点评]：bioRxiv 创始团队对自己平台的详细介绍，阐述了其设计理念、增长数据以及对生物学出版文化的愿景。
[3] Fraser N, et al. (2020). The relationship between bioRxiv preprints, publication and attention metrics. Quant Sci Stud.
[点评]：数据证明了“预印本优势”：在 bioRxiv 发过预印本的论文，最终发表后的引用率和媒体关注度显著高于直接投期刊的论文。