Nature Genetics

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Nature Genetics 是由 Nature Portfolio(施普林格·自然集团旗下)出版的国际顶级月刊,创刊于 1992 年。它是遗传学和基因组学领域影响力最高、引用率最广的同行评审期刊之一。
该期刊主要发表关于人类及其他模式生物(如小鼠、果蝇、植物)遗传学基础的高质量研究。它是全基因组关联分析GWAS)、癌症基因组图谱以及复杂性状遗传基础研究的主要发表阵地。
在 2023 年 JCR 分区中,其影响因子(Impact Factor)约为 30.8,常年稳居遗传学与遗传性(Genetics & Heredity)分类的榜首或前三,被视为该领域的“风向标”。

Nature Genetics
               IF: 30.8
High Impact Journal (点击展开)
遗传学界的“圣杯”
期刊档案
创刊年份 1992年
出版机构 Nature Portfolio
出版周期 月刊 (Monthly)
影响因子 30.8 (2023 JCR)
内容特征
关注重点 GWAS, 功能基因组
文章类型 Article, Letter, Brief
出版模式 混合 (Transformative)
地位 遗传学 Top 1

GWAS 时代的定义者

如果说 NatureScience 关注最广泛的科学突破,那么 Nature Genetics 则是复杂性状遗传学的大本营。

核心主题 典型内容 代表性成果
GWAS 寻找常见变异与疾病(如糖尿病、精神分裂症)的关联。 该期刊定义了 GWAS 的统计学标准(如 P < 5×10⁻⁸)和曼哈顿图的展示规范。
癌症基因组 识别肿瘤的驱动突变 (Driver Mutations)。 TCGAICGC 计划的许多分项成果发表于此。
统计遗传学 开发新的算法来解释遗传度 (Heritability)。 LD Score RegressionPRS (多基因风险评分) 的方法学论文。

从发现基因到解释功能

近年来,Nature Genetics 的重心已从单纯的“基因挖掘”转向“功能解析”。它越来越青睐那些结合了表观遗传学(ChIP-seqATAC-seq)和 3D 基因组(Hi-C)技术,能够解释非编码区变异如何调控基因表达的研究。

  • Post-GWAS 时代: 仅发现位点已不够,必须通过 CRISPR 筛选或 QTL 分析(eQTL, pQTL)来验证因果基因。
  • 单细胞遗传学: 结合 scRNA-seq 技术,在单细胞分辨率下解析体细胞突变或发育过程中的遗传调控。
  • 农业与进化: 除了人类,该刊也刊登重要农作物(如水稻、玉米)的基因组组装以及物种进化的重磅论文。
       关键相关概念 [Key Concepts]
       

1. Manhattan Plot (曼哈顿图): Nature Genetics 论文中最具标志性的图表。用于直观展示 GWAS 结果,X 轴为染色体坐标,Y 轴为 -log10(P值),显著位点像摩天大楼一样耸立。

2. Missing Heritability (遗传度缺失): 这是一个在该期刊上被反复讨论的经典问题。即 GWAS 发现的所有位点解释的遗传变异总和,往往远低于通过双胞胎研究估算的遗传度。

3. Fine-mapping (精细定位): 在发现显著区域后,利用统计算法(如贝叶斯方法)确定真正的致病变异(Causal Variant)的过程,是目前该刊论文的标准配置。

       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Yang J, et al. (2010). Common SNPs explain a large proportion of the heritability for human height. Nature Genetics.
[点评]:历史性论文。提出了 GCTA 方法,首次证明了“缺失的遗传度”其实隐藏在大量效应极微小的常见变异中,改变了大家对复杂性状遗传基础的认知。

[2] Kircher M, et al. (2014). A general framework for estimating the relative pathogenicity of human genetic variants. Nature Genetics.
[点评]:提出了 CADD score(C-score)。这是一种整合了多种注释信息的评分工具,用于预测全基因组范围内变异的致病性,是临床遗传分析的必备工具。

[3] Bulik-Sullivan BK, et al. (2015). LD Score regression distinguishes confounding from polygenicity in genome-wide association studies. Nature Genetics.
[点评]:开发了 LDSC(连锁不平衡分数回归)方法。它能够仅利用 GWAS 汇总统计数据(Summary Statistics)来估算遗传度和遗传相关性,极大地推动了跨表型研究。

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