Nucleic Acids Res
Nucleic Acids Research(通常缩写为 NAR)是由 Oxford University Press(牛津大学出版社)出版的国际顶级生物医学期刊。该杂志创刊于 1974 年,专注于发表关于核酸(DNA 和 RNA)及其相关蛋白的物理、化学、生化和生物学方面的前沿研究。
NAR 是生物信息学和分子生物学领域极其重要的资源,尤其是其每年 1 月出版的“数据库专刊”(Database Issue)和 7 月出版的“Web服务器专刊”(Web Server Issue),被视为全球生物数据库和在线分析工具的权威目录。
该期刊采用完全的开放获取(Gold Open Access)模式,在 2023 年 JCR 分区中,其影响因子(Impact Factor)约为 16.6,属于生物化学与分子生物学领域的 Top 期刊。
两大年度特刊:生物信息学的“年鉴”
NAR 之所以对生物信息学社区如此重要,主要归功于其每年雷打不动的两期特刊。这些特刊汇总了当年最新、最好用的数据库和工具。
| 专刊 (Special Issue) | 出版时间 | 内容焦点 |
|---|---|---|
| Database Issue (数据库专刊) |
每年 1 月 | 生物数据库的目录。发表新建立的数据库(如新的植物基因组DB)或著名数据库(如 GenBank, UniProt, Ensembl)的年度重大更新。 |
| Web Server Issue (Web服务器专刊) |
每年 7 月 | 在线分析工具的集合。专注于那些无需用户安装、通过浏览器即可使用的软件(如引物设计、序列比对、结构预测工具)。 |
不仅仅是生信:广泛的学科覆盖
虽然 NAR 在生信领域名声大噪,但其基础研究板块(Standard Issues)同样极具影响力,涵盖了分子生物学的核心机制。
- 基因调控: 转录因子结合、染色质重塑、表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰)。
- RNA 生物学: 非编码 RNA(lncRNA, miRNA)、RNA 剪接、RNA 编辑及核糖体功能。
- DNA 修复与复制: 损伤应答机制、CRISPR 基因编辑的分子机理。
- 核酸化学: DNA/RNA 的结构生物学、化学修饰及其检测方法。
关键相关概念 [Key Concepts]
1. Open Access (开放获取): NAR 是较早完全转型为 OA 的老牌期刊之一(2005年)。这意味任何人都可以免费阅读和下载其所有文章,极大地促进了数据库和工具的传播。
2. NAR Online Molecular Biology Database Collection: 由 NAR 维护的一个在线列表,汇集了历年 Database Issue 发表的数千个数据库,是寻找生物数据的“寻宝图”。
3. Methods (方法学): 除了数据库和服务器,NAR 也大量发表实验方法学论文(如新的 NGS 建库技术、单细胞测序改进),这类文章往往具有极高的引用率。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Rigden DJ, Fernandez-Suarez XM. (2024). The 2024 Nucleic Acids Research Database Issue and the online molecular biology database collection. Nucleic Acids Res.
[点评]:2024 年数据库专刊的社论。介绍了当年新增的数据库资源,并强调了数据维护和长期可用性的重要性。
[2] Gable AL, et al. (2023). The 2023 Nucleic Acids Research Web Server Issue. Nucleic Acids Res.
[点评]:Web Server 专刊的年度综述。涵盖了 AI 驱动的蛋白质结构预测(如 AlphaFold 相关工具)和单细胞分析工具的最新进展。
[3] Sayers EW, et al. (2022). GenBank 2022 update. Nucleic Acids Res.
[点评]:典型的 NAR 数据库更新文章。NCBI 等大型机构每年都会在 NAR 上发布其核心数据库(如 GenBank)的年度状态报告,引用率极高。