PharmGKB
PharmGKB（Pharmacogenomics Knowledge Base，药物基因组学知识库）是全球最权威的公共数据库，致力于收集、整理和传播关于人类基因变异对药物反应影响的知识。该项目由 Stanford University (斯坦福大学) 管理，并获得美国国立卫生研究院 (NIH) 的长期资助。PharmGKB 不仅汇集了从基础研究到临床试验的原始数据，还对基因-药物对（Gene-Drug Pairs）的临床证据等级进行了标准化评级。它是 CPIC 指南的官方发布平台，也是 FDA、EMA 等监管机构药物标签信息的整合中心，被视为精准用药领域的“中央处理器”。
证据金字塔：从文献到临床
PharmGKB 并不生产原始数据，而是作为“策展人” (Curator)，将海量的科研文献转化为结构化的知识。其核心贡献在于建立了严格的证据等级系统 (Levels of Evidence)：
| 等级 | 定义 |
|---|---|
| Level 1A | 指南级别。已被权威机构（如 CPIC 或 DPWG）纳入临床指南，或 FDA 标签中含有具体的处方建议。 |
| Level 1B | 强关联。多项重复研究证实关联性显著，但尚未被纳入主要指南。 |
| Level 2A/B | 中等证据。已知变异影响药物反应，但临床意义尚不明确，或主要针对特定族群。 |
| Level 3/4 | 初步/低证据。基于单项研究或体外实验，缺乏重复验证。 |
可视化通路：PK 与 PD
PharmGKB 最受欢迎的功能之一是其高度可视化的药物通路图 (Pathways)。这些通路图详细描绘了药物在细胞内的生命周期，不仅标注了参与反应的分子，还直接链接到相关的遗传变异。
- Pharmacokinetics (PK) 通路： 展示药物如何被转运体（如 ABCB1）吸收、被酶（如 CYP2D6）代谢以及被排泄。
- Pharmacodynamics (PD) 通路： 展示药物如何与受体结合，触发下游信号转导，从而产生疗效或副作用。
全球枢纽：超越国界
虽然由美国机构管理，PharmGKB 致力于整合全球资源。它不仅收录了美国的 CPIC 指南，还并列展示了：
- DPWG： 荷兰药物遗传学工作组指南。
- CPNDS： 加拿大药物基因组学网络指南。
- 监管标签： 并排对比 FDA（美国）、EMA（欧洲）、PMDA（日本）和 Swissmedic（瑞士）对同一药物的基因检测要求（如“强制检测” vs “推荐检测”）。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Whirl-Carrillo M, et al. (2012). Pharmacogenomics knowledge for personalized medicine. Clinical Pharmacology & Therapeutics.
[点评]：PharmGKB 的奠基性论文，详细介绍了知识库的架构、数据策展流程以及如何支持精准医疗。
[2] Barbarino JM, et al. (2018). PharmGKB: a worldwide resource for pharmacogenomic information. WIREs Systems Biology and Medicine.
[点评]：综述了 PharmGKB 作为全球 PGx 信息枢纽的演变，重点强调了其与 ClinGen 和 CPIC 的整合。
[3] Whirl-Carrillo M, et al. (2021). An Evidence-Based Framework for Evaluating Pharmacogenomics Knowledge for Precision Medicine. Clinical Pharmacology & Therapeutics.
[点评]：更新了 PharmGKB 的证据评分系统，使其更加符合临床实施的需求，为 CDS 系统提供了数据标准。