共价抑制剂

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共价抑制剂(Covalent Inhibitors),又称靶向共价药物(TCDs),是一类通过化学反应与靶蛋白上特定的亲核残基(通常是半胱氨酸、丝氨酸或赖氨酸)形成不可逆共价键的小分子药物。与传统的非共价抑制剂(仅依赖氢键、范德华力结合)不同,共价抑制剂的药效不再单纯取决于药物在血液中的浓度维持时间,而取决于靶蛋白的周转速率(Turnover rate)。这一特性使其能够实现极高的效力、延长的作用时间,并能靶向那些表面平坦、传统药物难以结合的“不可成药”靶点(如 KRAS G12C)。

共价抑制剂
Targeted Covalent Drugs (TCD) (点击展开)
机制:迈克尔加成反应形成共价键
药物化学特征
核心组件 弹头 (Warhead)
常见弹头 丙烯酰胺 (Acrylamide)
首选残基 半胱氨酸 (Cysteine)
评价指标 kinact / KI
代表药物 Ibrutinib, Osimertinib

分子机制:两步走的“锚定”过程

共价抑制剂的作用过程遵循特殊的两步机制,这与传统药物的一步结合平衡有本质区别:


  • 第一步(可逆识别): 
    药物通过非共价相互作用(氢键、疏水作用)结合到靶蛋白的结合口袋。这一步由亲和力常数 KI 决定,负责药物的初始定位和特异性识别。
  • 第二步(共价锁定): 
    一旦定位准确,药物上的亲电“弹头”(如丙烯酰胺基团)与蛋白口袋内特定的亲核残基(如 Cys481)发生化学反应(通常是迈克尔加成),形成不可逆的共价键。这一步由失活速率常数 kinact 决定。
  • PK/PD 解偶联: 
    一旦结合,即使血液中的药物被代谢清除,疗效依然持续,直到细胞合成新的蛋白分子来替换被“锁死”的旧蛋白。

共价 vs 非共价:范式对比

特性 可逆抑制剂 (Reversible) 共价抑制剂 (Covalent)
结合性质 平衡结合 (Equilibrium) 非平衡 (Nonequilibrium)
效力指标 IC50Kd kinact / KI (效率常数)
作用持续时间 依赖血药浓度 (PK驱动) 依赖蛋白更新 (Turnover驱动)
选择性基础 口袋形状互补 口袋形状 + 特定残基的存在

成功的药物案例

重磅炸弹的诞生

共价药物的复兴带来了多款改变临床实践的药物:
1. Osimertinib (奥希替尼): 第三代 EGFR-TKI,通过靶向 Cys797 克服 T790M 耐药。
2. Ibrutinib (伊布替尼): 第一代 BTK 抑制剂,通过靶向 Cys481 治疗 CLL 和 MCL。
3. Sotorasib (AMG 510): 靶向 KRAS G12C 突变的 Cys12,攻克了“不可成药”靶点。
4. 历史经典: 阿司匹林 (Aspirin) 和青霉素 (Penicillin) 其实也是典型的共价抑制剂,虽然它们发现时机理尚不明确。

       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Singh J, et al. (2011). The resurgence of covalent drugs. Nature Reviews Drug Discovery.
[点评]:该领域的奠基之作,系统总结了共价药物设计的原则、优势及安全性考量,标志着共价药物研发热潮的开始。

[2] Baillie TA. (2016). Targeted Covalent Inhibitors for Drug Design. Angewandte Chemie.
[点评]:详细讨论了如何通过优化“弹头”活性来平衡药效与潜在的脱靶毒性。

           药物设计 · 知识图谱
核心化学 迈克尔加成 (Michael Addition) • 亲电体 (Electrophile) • 亲核体
关键参数 驻留时间 (Residence Time) • 占有率 (Occupancy) • 脱靶毒性
应用靶点 BTK (C481) • EGFR (C797) • KRAS (G12C) • JAK3