质谱免疫组学

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质谱免疫组学
Immunopeptidomics
技术平台LC-MS/MS
核心目标HLA 提呈肽鉴别
灵敏度级别阿摩尔 (Amol) 级
起始样本$10^7 - 10^9$ 细胞
应用价值新抗原金标准

质谱免疫组学(Mass Spectrometry Immunopeptidomics)是一项基于高分辨率生物质谱技术,直接定性及定量分析由主要组织相容性复合体(MHC/HLA)提呈至细胞表面的内源性多肽(即“免疫肽组”)的前沿技术。该技术不依赖于免疫原性预测算法,能够直接提供细胞表面抗原景观的真实物理证据,是当前肿瘤免疫疗法中新抗原发现与验证的基石。


技术特性与临床评估

在临床转化应用中,质谱免疫组学展现出极高的证据等级,但其应用路径需结合以下客观特性进行综合考量:

  • 提呈丰度与免疫强度的非线性关系: 质谱检测到的高丰度肽段并不等同于强免疫原性,最终的靶点有效性需通过 T 细胞激活实验进一步验证。
  • 动态覆盖深度限制: 受限于质谱仪的动态范围,低拷贝数的突变肽段可能被高丰度的管家蛋白降解肽所掩盖。
  • 样本规模门槛: 为获取高质量的免疫肽谱,通常需要较大规模的生物样本,这在微小残留病灶(MRD)或细针穿刺活检中的应用仍面临挑战。

标准化流程与现代医学评估体系


<thead style="background-color: #0369a1; color: #ffffff; text-align: left;"> </thead> <tbody> </tbody>
核心环节 技术执行规范 (NRDD 标定) 关键性能考量
亲和富集 使用抗 HLA 特异性抗体(如 W6/32)进行免疫沉淀。 需严格控制非特异性吸附。
多肽洗脱 采用弱酸环境解离 HLA-肽复合物并回收微量肽段。 确保洗脱液不含有机溶剂残留。
生物信息解析 De novo 测序与特定突变库搜索(Search Engine)。 FDR(假阳性率)控制需 < 1%。

临床应用与学术价值

作为精准医疗的底层技术,质谱免疫组化在以下领域具有不可替代的价值:

  • 个性化新抗原筛选: 通过对比患者肿瘤组织与配对正常组织的肽谱,筛选出肿瘤特异性提呈肽段。
  • TCR 靶点特异性验证: 在开发针对 KRAS G12D 或其他热点突变的 TCR-T 疗法时,用于确证靶点肽段在特定 HLA 型别中的物理存在。
  • 自身免疫机制研究: 鉴定异常提呈的自身抗原片段,揭示疾病发生的免疫分子基础。
相关科学概念导航
肿瘤免疫 新抗原 (Neoantigen)T 细胞受体 (TCR)免疫检查点
组学技术 生物质谱De novo 测序MHC 配体组学