“质谱免疫组学”的版本间的差异

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   <div class="medical-infobox" style="float: right; width: 300px; margin: 0 0 20px 20px; padding: 20px; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; background: linear-gradient(180deg, #f8fafc 0%, #ffffff 100%); font-size: 0.85em; box-shadow: 0 4px 12px rgba(0,0,0,0.05); color: #334155;">
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   <div class="medical-infobox" style="float: right; width: 310px; margin: 0 0 25px 25px; padding: 20px; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; background: linear-gradient(180deg, #f8fafc 0%, #ffffff 100%); font-size: 0.85em; box-shadow: 0 4px 12px rgba(0,0,0,0.05); color: #334155;">
 
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     <div style="text-align: center; margin-bottom: 20px;">
 
       <div style="display: inline-block; padding: 25px; background: #ffffff; border-radius: 50%; border: 1px solid #cbd5e1; box-shadow: inset 0 2px 4px rgba(0,0,0,0.03);">
 
       <div style="display: inline-block; padding: 25px; background: #ffffff; border-radius: 50%; border: 1px solid #cbd5e1; box-shadow: inset 0 2px 4px rgba(0,0,0,0.03);">
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         <svg width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="#2563eb" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round"><path d="M2 20h20M5 20V8a2 2 0 0 1 2-2h10a2 2 0 0 1 2 2v12M9 20v-4a2 2 0 0 1 2-2h2a2 2 0 0 1 2 2v4M12 2v4"/></svg>
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         <svg width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="#0369a1" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round"><path d="M2 20h20M5 20V8a2 2 0 0 1 2-2h10a2 2 0 0 1 2 2v12M9 20v-4a2 2 0 0 1 2-2h2a2 2 0 0 1 2 2v4M12 2v4"/></svg>
 
       </div>
 
       </div>
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       <div style="font-weight: 700; font-size: 1.3em; margin-top: 12px; color: #0f172a;">质谱免疫组学</div>
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       <div style="font-weight: 700; font-size: 1.3em; margin-top: 15px; color: #0f172a; letter-spacing: -0.01em;">质谱免疫组学</div>
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       <div style="font-style: italic; color: #64748b; margin-bottom: 10px;">Immunopeptidomics</div>
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       <div style="font-style: italic; color: #64748b; margin-top: 4px;">Immunopeptidomics</div>
 
     </div>
 
     </div>
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     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 8px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">核心技术</span><span style="font-weight: 600;">LC-MS/MS</span></div>
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     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 10px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">技术平台</span><span style="font-weight: 600;">LC-MS/MS</span></div>
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     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 8px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">主要靶点</span><span style="font-weight: 600;">HLA 结合肽</span></div>
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     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 10px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">核心目标</span><span style="font-weight: 600;">HLA 提呈肽鉴别</span></div>
−
     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 8px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">常用平台</span><span style="font-weight: 600;">Orbitrap / timsTOF</span></div>
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     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 10px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">灵敏度级别</span><span style="font-weight: 600;">阿摩尔 (Amol) 级</span></div>
−
     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 8px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">样本起始</span><span style="font-weight: 600;">$10^{7}-10^{9}$ 细胞</span></div>
+
     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 10px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">起始样本</span><span style="font-weight: 600;">$10^7 - 10^9$ 细胞</span></div>
−
     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 8px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">所属学科</span><span style="font-weight: 600;">免疫蛋白组学</span></div>
+
     <div style="border-top: 1px solid #f1f5f9; padding: 10px 0; display: flex; justify-content: space-between;"><span style="color: #64748b;">应用价值</span><span style="font-weight: 600;">新抗原金标准</span></div>
 
   </div>
 
   </div>
  
−
   <p><b>质谱免疫组学</b>（Immunopeptidomics）是一门利用高灵敏度液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术，直接鉴定并定量由主要组织相容性复合体（MHC，在人类中称为 HLA）分子呈递在细胞表面的全部内源性肽段（免疫肽组）的学科。它是肿瘤新抗原发现、疫苗设计及 TCR-T 细胞疗法开发中不可逾越的“真实性验证”环节。</p>
+
   <p><b>质谱免疫组学</b>（Mass Spectrometry Immunopeptidomics）是一项基于高分辨率生物质谱技术，直接定性及定量分析由主要组织相容性复合体（MHC/HLA）提呈至细胞表面的内源性多肽（即“免疫肽组”）的前沿技术。该技术不依赖于免疫原性预测算法，能够直接提供细胞表面抗原景观的真实物理证据，是当前肿瘤免疫疗法中新抗原发现与验证的基石。</p>
  
−
   <h2 style="border-bottom: 2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 5px; color: #1e3a8a; font-size: 1.5em; margin-top: 30px;">学术立场：实话实说</h2>
+
 
−
   <div style="background-color: #fef2f2; border-left: 4px solid #dc2626; padding: 15px; margin: 20px 0; border-radius: 0 8px 8px 0;">
+
 
−
     <p style="margin: 0; color: #991b1b; font-weight: 600;">核心局限性评估：</p>
+
   <h2 style="border-left: 5px solid #0369a1; padding-left: 12px; color: #0f172a; font-size: 1.4em; margin-top: 35px; background: #f8fafc;">技术特性与临床评估</h2>
−
     <ul style="margin: 10px 0 0 20px; color: #7f1d1d; font-size: 0.95em;">
+
   <div style="padding: 10px 0;">
−
       <li><b>物理检测不代表功能激活：</b>质谱鉴定出的肽段仅证明其被“呈递”，能否激活 T 细胞仍需依赖 ELISpot 等功能实验。</li>
+
     <p>在临床转化应用中，质谱免疫组学展现出极高的证据等级，但其应用路径需结合以下客观特性进行综合考量：</p>
−
       <li><b>动态范围挑战：</b>高丰度管家蛋白肽常掩盖极低丰度的肿瘤特异性突变肽，导致漏检率。</li>
+
     <ul style="color: #475569; font-size: 0.95em;">
−
       <li><b>样本依赖性：</b>目前该技术对小尺寸活检样本（如微型穿刺）的支持度有限，难以实现常规临床化。</li>
+
       <li><b>提呈丰度与免疫强度的非线性关系：</b> 质谱检测到的高丰度肽段并不等同于强免疫原性，最终的靶点有效性需通过 T 细胞激活实验进一步验证。</li>
 +
       <li><b>动态覆盖深度限制：</b> 受限于质谱仪的动态范围，低拷贝数的突变肽段可能被高丰度的管家蛋白降解肽所掩盖。</li>
 +
       <li><b>样本规模门槛：</b> 为获取高质量的免疫肽谱，通常需要较大规模的生物样本，这在微小残留病灶（MRD）或细针穿刺活检中的应用仍面临挑战。</li>
 
     </ul>
 
     </ul>
 
   </div>
 
   </div>
  
−
   <h2 style="border-bottom: 2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 5px; color: #1e3a8a; font-size: 1.5em; margin-top: 30px;">技术流程与关键指标</h2>
+
   <h2 style="border-left: 5px solid #0369a1; padding-left: 12px; color: #0f172a; font-size: 1.4em; margin-top: 30px; background: #f8fafc;">标准化流程与现代医学评估体系</h2>
−
   <p>质谱免疫组化的标准化流程涉及样本采集、HLA 免疫沉淀、肽段洗脱及质谱采集。以下为临床转化层面的核心参数分析：</p>
+
    
 +
 
  
−
   <div style="width: 90%; margin: 25px auto; overflow: hidden; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 10px; box-shadow: 0 10px 15px -3px rgba(0,0,0,0.1);">
+
   <div style="width: 90%; margin: 25px auto; overflow: hidden; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; box-shadow: 0 4px 6px -1px rgba(0,0,0,0.05);">
−
     <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; font-size: 0.9em; text-align: left;">
+
     <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; font-size: 0.92em; background-color: #ffffff;">
−
       <thead style="background-color: #1e40af; color: #ffffff;">
+
       <thead style="background-color: #0369a1; color: #ffffff; text-align: left;">
 
         <tr>
 
         <tr>
−
           <th style="padding: 15px; border-bottom: 2px solid #1d4ed8;">技术环节</th>
+
           <th style="padding: 14px; width: 20%;">核心环节</th>
−
           <th style="padding: 15px; border-bottom: 2px solid #1d4ed8;">操作规范 (NRDD 准则)</th>
+
           <th style="padding: 14px;">技术执行规范 (NRDD 标定)</th>
−
           <th style="padding: 15px; border-bottom: 2px solid #1d4ed8;">技术风险点</th>
+
           <th style="padding: 14px;">关键性能考量</th>
 
         </tr>
 
         </tr>
 
       </thead>
 
       </thead>
−
       <tbody style="background-color: #ffffff;">
+
       <tbody>
 
         <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
 
         <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
−
           <td style="padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #1e3a8a;">样本富集</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; font-weight: 600; color: #0369a1;">亲和富集</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px;">基于 W6/32 等单抗的 HLA 复合物亲和纯化。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px;">使用抗 HLA 特异性抗体（如 W6/32）进行免疫沉淀。</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px; color: #ef4444;">非特异性结合产生的干扰噪声。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; color: #64748b;">需严格控制非特异性吸附。</td>
 
         </tr>
 
         </tr>
−
         <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9; background-color: #f8fafc;">
+
         <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9; background-color: #fbfcfd;">
−
           <td style="padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #1e3a8a;">质谱采集</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; font-weight: 600; color: #0369a1;">多肽洗脱</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px;">DDA (数据依赖型) 或 DIA (数据无关型) 扫描。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px;">采用弱酸环境解离 HLA-肽复合物并回收微量肽段。</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px; color: #ef4444;">低丰度肽段的质子化信号微弱。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; color: #64748b;">确保洗脱液不含有机溶剂残留。</td>
 
         </tr>
 
         </tr>
 
         <tr>
 
         <tr>
−
           <td style="padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #1e3a8a;">序列解析</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; font-weight: 600; color: #0369a1;">生物信息解析</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px;">De novo 测序配合自定义突变蛋白库搜库。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px;"><i>De novo</i> 测序与特定突变库搜索（Search Engine）。</td>
−
           <td style="padding: 12px 15px; color: #ef4444;">非经典翻译来源（内含子）解析极难。</td>
+
           <td style="padding: 12px 14px; color: #64748b;">FDR（假阳性率）控制需 < 1%。</td>
 
         </tr>
 
         </tr>
 
       </tbody>
 
       </tbody>
第60行： 第63行：
 
   </div>
 
   </div>
  
−
   <h2 style="border-bottom: 2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 5px; color: #1e3a8a; font-size: 1.5em; margin-top: 30px;">临床关联与应用</h2>
+
   <h2 style="border-left: 5px solid #0369a1; padding-left: 12px; color: #0f172a; font-size: 1.4em; margin-top: 30px; background: #f8fafc;">临床应用与学术价值</h2>
 +
  <p>作为精准医疗的底层技术，质谱免疫组化在以下领域具有不可替代的价值：</p>
 
   <ul>
 
   <ul>
−
     <li><b>癌症个性化疫苗：</b>通过质谱筛选真实提呈的突变位点，避免资源浪费在无效肽段上。</li>
+
     <li><b>个性化新抗原筛选：</b> 通过对比患者肿瘤组织与配对正常组织的肽谱，筛选出肿瘤特异性提呈肽段。</li>
−
     <li><b>TCR 靶点筛选：</b>针对 <b>KRAS G12D</b> 等驱动突变，确认其在不同 HLA 亚型中的提呈图谱。</li>
+
     <li><b>TCR 靶点特异性验证：</b> 在开发针对 <b>KRAS G12D</b> 或其他热点突变的 TCR-T 疗法时，用于确证靶点肽段在特定 HLA 型别中的物理存在。</li>
−
     <li><b>药效评价：</b>监测免疫检查点抑制剂（ICI）或化疗前后，肿瘤表面肽组的动态漂移。</li>
+
     <li><b>自身免疫机制研究：</b> 鉴定异常提呈的自身抗原片段，揭示疾病发生的免疫分子基础。</li>
 
   </ul>
 
   </ul>
  
−
   <div style="clear: both; margin-top: 40px; border: 1px solid #cbd5e1; background-color: #f1f5f9; border-radius: 6px; overflow: hidden;">
+
   <div style="clear: both; margin-top: 45px; border: 1px solid #cbd5e1; border-radius: 8px; overflow: hidden; background-color: #f9fafb;">
−
     <div style="background-color: #1e3a8a; text-align: center; font-weight: bold; padding: 8px; color: #ffffff;">肿瘤免疫技术导航</div>
+
     <div style="background-color: #334155; text-align: center; font-weight: bold; padding: 10px; color: #ffffff; letter-spacing: 1px;">相关科学概念导航</div>
−
     <table style="width: 100%; border-spacing: 0; font-size: 0.85em;">
+
     <table style="width: 100%; border-spacing: 0; font-size: 0.85em; color: #475569;">
 
       <tr>
 
       <tr>
−
         <td style="width: 20%; padding: 10px; background-color: #e2e8f0; text-align: right; font-weight: 600;">关联组学</td>
+
         <td style="width: 20%; padding: 12px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; font-weight: 600; border-right: 1px solid #e2e8f0;">肿瘤免疫</td>
−
         <td style="padding: 10px;">[[蛋白组学]] • [[转录组学]] • [[全外显子测序]]</td>
+
         <td style="padding: 12px;">[[新抗原 (Neoantigen)]] • [[T 细胞受体 (TCR)]] • [[免疫检查点]]</td>
 
       </tr>
 
       </tr>
 
       <tr>
 
       <tr>
−
         <td style="width: 20%; padding: 10px; background-color: #e2e8f0; text-align: right; font-weight: 600;">临床终端</td>
+
         <td style="width: 20%; padding: 12px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; font-weight: 600; border-right: 1px solid #e2e8f0; border-top: 1px solid #e2e8f0;">组学技术</td>
−
         <td style="padding: 10px;">[[新抗原疫苗]] • [[TCR-T 疗法]] • [[CAR-NK]]</td>
+
         <td style="padding: 12px; border-top: 1px solid #e2e8f0;">[[生物质谱]] • [[De novo 测序]] • [[MHC 配体组学]]</td>
 
       </tr>
 
       </tr>
 
     </table>
 
     </table>

2025年12月25日 (四) 02:37的版本

       <svg width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="#0369a1" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round"><path d="M2 20h20M5 20V8a2 2 0 0 1 2-2h10a2 2 0 0 1 2 2v12M9 20v-4a2 2 0 0 1 2-2h2a2 2 0 0 1 2 2v4M12 2v4"/></svg>
质谱免疫组学
Immunopeptidomics
技术平台LC-MS/MS
核心目标HLA 提呈肽鉴别
灵敏度级别阿摩尔 (Amol) 级
起始样本$10^7 - 10^9$ 细胞
应用价值新抗原金标准

质谱免疫组学（Mass Spectrometry Immunopeptidomics）是一项基于高分辨率生物质谱技术，直接定性及定量分析由主要组织相容性复合体（MHC/HLA）提呈至细胞表面的内源性多肽（即“免疫肽组”）的前沿技术。该技术不依赖于免疫原性预测算法，能够直接提供细胞表面抗原景观的真实物理证据，是当前肿瘤免疫疗法中新抗原发现与验证的基石。


技术特性与临床评估

在临床转化应用中，质谱免疫组学展现出极高的证据等级，但其应用路径需结合以下客观特性进行综合考量：

  • 提呈丰度与免疫强度的非线性关系： 质谱检测到的高丰度肽段并不等同于强免疫原性，最终的靶点有效性需通过 T 细胞激活实验进一步验证。
  • 动态覆盖深度限制： 受限于质谱仪的动态范围，低拷贝数的突变肽段可能被高丰度的管家蛋白降解肽所掩盖。
  • 样本规模门槛： 为获取高质量的免疫肽谱，通常需要较大规模的生物样本，这在微小残留病灶（MRD）或细针穿刺活检中的应用仍面临挑战。

标准化流程与现代医学评估体系


<thead style="background-color: #0369a1; color: #ffffff; text-align: left;"> </thead> <tbody> </tbody>
核心环节 技术执行规范 (NRDD 标定) 关键性能考量
亲和富集 使用抗 HLA 特异性抗体（如 W6/32）进行免疫沉淀。 需严格控制非特异性吸附。
多肽洗脱 采用弱酸环境解离 HLA-肽复合物并回收微量肽段。 确保洗脱液不含有机溶剂残留。
生物信息解析 De novo 测序与特定突变库搜索（Search Engine）。 FDR（假阳性率）控制需 < 1%。

临床应用与学术价值

作为精准医疗的底层技术，质谱免疫组化在以下领域具有不可替代的价值：

  • 个性化新抗原筛选： 通过对比患者肿瘤组织与配对正常组织的肽谱，筛选出肿瘤特异性提呈肽段。
  • TCR 靶点特异性验证： 在开发针对 KRAS G12D 或其他热点突变的 TCR-T 疗法时，用于确证靶点肽段在特定 HLA 型别中的物理存在。
  • 自身免疫机制研究： 鉴定异常提呈的自身抗原片段，揭示疾病发生的免疫分子基础。
相关科学概念导航
肿瘤免疫 新抗原 (Neoantigen) • T 细胞受体 (TCR) • 免疫检查点
组学技术 生物质谱 • De novo 测序 • MHC 配体组学
取自“https://www.yiliao.com/index.php?title=质谱免疫组学&oldid=310687”