高通量筛选
高通量筛选(High-Throughput Screening,HTS)是现代药物发现工业化流程中的核心技术。它利用精密的自动化机器人系统、高灵敏度的微板检测仪器和强大的数据处理软件,在微孔板(如 384 孔或 1536 孔板)上对数以万计甚至百万计的 化合物库 进行快速、并行的生物活性测试。HTS 的核心目标是从海量样本中筛选出能够特异性调节生物靶点(如激酶、GPCR)活性的 苗头化合物 (Hits),为后续的 先导化合物 优化奠定基础。近年来,随着 DNA编码化合物库 (DEL) 和 CRISPR筛选 的出现,HTS 的通量和维度得到了指数级的提升。
核心流程:从靶点到苗头
HTS 是一个跨学科的系统工程,其标准流程通常包括四个阶段:
- 1. 实验开发 (Assay Development): 将生物学反应(如酶与底物结合、受体激活)转化为可检测的光学信号(如荧光、发光)。关键是使实验适应微孔板格式并具有高稳定性。
- 2. 初级筛选 (Primary Screen): 对数万至数百万个化合物进行单浓度(Single point)测试。通常设定一个阈值(如抑制率 > 50%)来挑选“活性”化合物。
- 3. 命中确认 (Hit Confirmation): 对初筛阳性孔进行复孔测试,排除假阳性(False Positives),并进行剂量-反应曲线(Dose-response)分析以测定 IC50 或 EC50。
- 4. 反筛选 (Counter Screen): 排除非特异性结合或具有细胞毒性的化合物(Pan-assay interference compounds, PAINS)。
检测技术:光学的魔法
为了在微升体系中获得高信噪比,HTS 依赖于先进的光学检测技术。
| 技术类别 | 代表方法 | 原理与优势 |
|---|---|---|
| 荧光技术 | FRET, TR-FRET, FP | 荧光共振能量转移 (FRET) 可检测分子间距离变化(如蛋白-蛋白相互作用)。TR-FRET 利用长寿命荧光(如铕)消除背景干扰。 |
| 发光技术 | Luciferase, ATP Lite | 利用萤火虫荧光素酶。背景极低,灵敏度极高,常用于检测细胞活力或基因报告系统。 |
| 高内涵 | 高内涵筛选 (HCS) | 结合自动显微成像与图像分析。不仅看“死活”,还能看蛋白定位、细胞形态、神经突触生长等复杂表型。 |
| 非标记 | SPR, 质谱 (SAMDI) | 无需荧光标记,直接检测分子质量或折射率变化,避免标记对活性的影响。 |
质量控制:Z因子的统治
在 HTS 中,判断一个实验是否可靠,最权威的统计学参数是 Z因子 (Z-Factor)。
Z = 1 -
3(σp + σn)
|μp - μn|
其中 σ 是标准差,μ 是平均值
p 代表阳性对照 (Positive),n 代表阴性对照 (Negative)
- 1.0 > Z ≥ 0.5: 优秀的筛选实验(Excellent)。信号窗口大,误差小。
- 0.5 > Z > 0: 勉强可用(Marginal),可能需要优化。
- Z < 0: 实验失败。信号与背景重叠,无法区分。
学术参考文献 [Academic Review]
[1] Zhang JH, Chung TD, Oldenburg KR. (1999). A Simple Statistical Parameter for Use in Evaluation and Validation of High Throughput Screening Assays. Journal of Biomolecular Screening.
[点评]:经典文献。提出了 Z-Factor 概念,成为衡量 HTS 数据质量的行业金标准。
[2] Macarron R, et al. (2011). Impact of high-throughput screening in biomedical research. Nature Reviews Drug Discovery.
[点评]:全面回顾了 HTS 技术在过去几十年中对新药发现的贡献,讨论了从靶点筛选到表型筛选的转变。
[3] Abraham BK, et al. (2004). High content screening applied to large-scale cell biology. Trends in Biotechnology.
[点评]:讨论了 HTS 向 HCS(高内涵)的进化,强调了图像数据在理解复杂细胞生物学中的价值。