高通量筛选

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高通量筛选(High-Throughput Screening,HTS)是现代药物发现工业化流程中的核心技术。它利用精密的自动化机器人系统、高灵敏度的微板检测仪器和强大的数据处理软件,在微孔板(如 384 孔或 1536 孔板)上对数以万计甚至百万计的 化合物库 进行快速、并行的生物活性测试。HTS 的核心目标是从海量样本中筛选出能够特异性调节生物靶点(如激酶、GPCR)活性的 苗头化合物 (Hits),为后续的 先导化合物 优化奠定基础。近年来,随着 DNA编码化合物库 (DEL)CRISPR筛选 的出现,HTS 的通量和维度得到了指数级的提升。

高通量筛选
High-Throughput Screening (点击展开)
药物发现的工业引擎
技术概况
英文缩写 HTS
通量定义 >10,000 样本/天
关键耗材 384/1536 孔板
筛选对象 小分子, siRNA, CRISPR
质量控制
核心指标 Z因子 (Z-Factor)
理想范围 0.5 < Z < 1.0
信噪比 S/N > 10
进阶技术 高内涵筛选 (HCS)

核心流程:从靶点到苗头

HTS 是一个跨学科的系统工程,其标准流程通常包括四个阶段:


  • 1. 实验开发 (Assay Development): 将生物学反应(如酶与底物结合、受体激活)转化为可检测的光学信号(如荧光、发光)。关键是使实验适应微孔板格式并具有高稳定性。
  • 2. 初级筛选 (Primary Screen): 对数万至数百万个化合物进行单浓度(Single point)测试。通常设定一个阈值(如抑制率 > 50%)来挑选“活性”化合物。
  • 3. 命中确认 (Hit Confirmation): 对初筛阳性孔进行复孔测试,排除假阳性(False Positives),并进行剂量-反应曲线(Dose-response)分析以测定 $\text{IC}_{50}$ 或 $\text{EC}_{50}$。
  • 4. 反筛选 (Counter Screen): 排除非特异性结合或具有细胞毒性的化合物(Pan-assay interference compounds, PAINS)。

检测技术:光学的魔法

为了在微升体系中获得高信噪比,HTS 依赖于先进的光学检测技术。

技术类别 代表方法 原理与优势
荧光技术 FRET, TR-FRET, FP 荧光共振能量转移 (FRET) 可检测分子间距离变化(如蛋白-蛋白相互作用)。TR-FRET 利用长寿命荧光(如铕)消除背景干扰。
发光技术 Luciferase, ATP Lite 利用萤火虫荧光素酶。背景极低,灵敏度极高,常用于检测细胞活力或基因报告系统。
高内涵 高内涵筛选 (HCS) 结合自动显微成像与图像分析。不仅看“死活”,还能看蛋白定位、细胞形态、神经突触生长等复杂表型。
非标记 SPR, 质谱 (SAMDI) 无需荧光标记,直接检测分子质量或折射率变化,避免标记对活性的影响。

质量控制:Z因子的统治

在 HTS 中,判断一个实验是否可靠,最权威的统计学参数是 Z因子 (Z-Factor)
$$ Z = 1 - \frac{3(\sigma_p + \sigma_n)}{|\mu_p - \mu_n|} $$
其中 $\sigma$ 是标准差,$\mu$ 是平均值,$p$ 和 $n$ 分别代表阳性对照和阴性对照。

  • 1.0 > Z ≥ 0.5: 优秀的筛选实验(Excellent)。
  • 0.5 > Z > 0: 勉强可用(Marginal),需优化。
  • Z < 0: 实验失败,无法区分信号与噪音。
       学术参考文献 [Academic Review]
       

[1] Zhang JH, Chung TD, Oldenburg KR. (1999). A Simple Statistical Parameter for Use in Evaluation and Validation of High Throughput Screening Assays. Journal of Biomolecular Screening.
[点评]:经典文献。提出了 Z-Factor 概念,成为衡量 HTS 数据质量的行业金标准。

[2] Macarron R, et al. (2011). Impact of high-throughput screening in biomedical research. Nature Reviews Drug Discovery.
[点评]:全面回顾了 HTS 技术在过去几十年中对新药发现的贡献,讨论了从靶点筛选到表型筛选的转变。

[3] Abraham BK, et al. (2004). High content screening applied to large-scale cell biology. Trends in Biotechnology.
[点评]:讨论了 HTS 向 HCS(高内涵)的进化,强调了图像数据在理解复杂细胞生物学中的价值。

           药物筛选技术网络 · 知识图谱
上级学科 药物发现生物技术
核心资源 化合物库DELCRISPR文库 • 细胞株
衍生技术 虚拟筛选 (CADD) • 高内涵筛选 (HCS) • 片段筛选 (FBDD)