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CoolMPS - 版本历史
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<br />
<div style="margin-bottom: 30px; border-bottom: 1.2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 25px;"><br />
<p style="font-size: 1.1em; margin: 10px 0; color: #334155; text-align: justify;"><br />
<strong>CoolMPS</strong>（Cold Antibody-based Sequencing，冷抗体测序技术）是<strong>[[华大智造]] (MGI)</strong> 自主研发的一项革命性<strong>[[高通量测序]]</strong>生化技术。与传统的<strong>[[边合成边测序]] (SBS)</strong> 不同，CoolMPS 并不在核苷酸上直接连接荧光基团，而是引入了<strong>[[单克隆抗体]]</strong>作为信号介质。在测序循环中，特异性抗体识别并结合到刚掺入的核苷酸上，抗体携带的荧光基团发出信号。检测完成后，抗体和 3' 端阻断基团被一并切除。这种设计实现了真正的<strong>“无痕” (Scarless)</strong> 测序，避免了传统技术中化学疤痕（Chemical Scar）的累积，从而显著提升了测序信号的信噪比和准确度，特别是对于长读长的测序质量。<br />
</p><br />
</div><br />
<br />
<div class="medical-infobox mw-collapsible mw-collapsed" style="width: 100%; max-width: 320px; margin: 0 auto 35px auto; border: 1.2px solid #bae6fd; border-radius: 12px; background-color: #ffffff; box-shadow: 0 8px 20px rgba(0,0,0,0.05); overflow: hidden;"><br />
<br />
<div style="padding: 15px; color: #1e40af; background: linear-gradient(135deg, #e0f2fe 0%, #bae6fd 100%); text-align: center; cursor: pointer;"><br />
<div style="font-size: 1.2em; font-weight: bold; letter-spacing: 1.2px;">CoolMPS</div><br />
<div style="font-size: 0.7em; opacity: 0.85; margin-top: 4px; white-space: nowrap;">抗体偶联无痕测序 (点击展开)</div><br />
</div><br />
<br />
<div class="mw-collapsible-content"><br />
<div style="padding: 25px; text-align: center; background-color: #f8fafc;"><br />
<div style="width: 100px; height: 100px; background-color: #e2e8f0; border-radius: 50%; margin: 0 auto; display: flex; align-items: center; justify-content: center; color: #94a3b8; font-size: 0.8em;"><br />
<br />
</div><br />
<div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; margin-top: 12px; font-weight: 600;">重新定义测序化学</div><br />
</div><br />
<br />
<table style="width: 100%; border-spacing: 0; border-collapse: collapse; font-size: 0.85em;"><br />
<tr><br />
<th colspan="2" style="padding: 8px 12px; background-color: #e0f2fe; color: #1e40af; text-align: left; font-size: 0.9em; border-top: 1px solid #bae6fd;">技术属性</th><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; width: 40%;">研发机构</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">[[华大智造]] (MGI)</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">核心载体</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">[[DNA纳米球]] (DNB)</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">信号介质</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #16a34a;">荧光标记抗体</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">最大优势</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #e11d48;">无痕 (Scarless)</td><br />
</tr><br />
<br />
<tr><br />
<th colspan="2" style="padding: 8px 12px; background-color: #e0f2fe; color: #1e40af; text-align: left; font-size: 0.9em; border-top: 1px solid #bae6fd;">性能指标</th><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">准确度</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">[[Q30]] > 90%</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">信号强度</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">传统SBS的 3倍+</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">适用平台</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">DNBSEQ-G400 等</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f8fafc; color: #475569;">发表时间</th><br />
<td style="padding: 6px 12px; color: #0f172a;">2019年</td><br />
</tr><br />
</table><br />
</div><br />
</div><br />
<br />
<h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">核心机制：抗体充当“信使”</h2><br />
<br />
<p style="margin: 15px 0; text-align: justify;"><br />
CoolMPS 的命名源自 "Cold"（冷），意指在聚合反应阶段，加入的核苷酸是“冷”的（未标记荧光），这与 Illumina 的“热”核苷酸（直接标记荧光）形成对比。其循环过程包含独特的抗体结合步骤：<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
<div style="background-color: #f0f9ff; border-left: 5px solid #1e40af; padding: 15px 20px; margin: 20px 0; border-radius: 4px;"><br />
<ul style="margin: 0; padding-left: 20px; color: #334155;"><br />
<li style="margin-bottom: 8px;"><strong>1. 掺入 (Incorporation)：</strong> DNA 聚合酶将带有 3' 阻断基团的“冷”核苷酸（无荧光）掺入到生长链中。</li><br />
<li style="margin-bottom: 8px;"><strong>2. 结合 (Binding)：</strong> 加入四种特异性识别 A、T、C、G 碱基上特定修饰的<strong>[[单克隆抗体]]</strong>。这些抗体上偶联了高亮度的荧光染料。</li><br />
<li style="margin-bottom: 8px;"><strong>3. 成像 (Imaging)：</strong> 激发荧光并拍照，记录碱基序列。</li><br />
<li style="margin-bottom: 0;"><strong>4. 再生 (Regeneration)：</strong> 加入消化试剂，将抗体和 3' 阻断基团一并切除。DNA 链恢复为天然的化学结构，准备下一轮循环。</li><br />
</ul><br />
</div><br />
<br />
<h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">无痕优势：告别化学疤痕</h2><br />
<br />
<p style="margin: 15px 0; text-align: justify;"><br />
CoolMPS 对比传统 SBS 最大的优势在于解决了<strong>化学疤痕 (Chemical Scar)</strong> 问题。<br />
</p><br />
<br />
<div style="overflow-x: auto; margin: 20px auto;"><br />
<table style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1.2px solid #cbd5e1; font-size: 0.9em; text-align: left;"><br />
<tr style="background-color: #f1f5f9; border-bottom: 2px solid #0f172a;"><br />
<th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #0f172a; width: 20%;">特性</th><br />
<th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af; width: 40%;">传统 SBS (Illumina)</th><br />
<th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #475569; width: 40%;">CoolMPS (MGI)</th><br />
</tr><br />
<tr><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">残留物</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">荧光基团切除后，碱基上残留一段 Linker（疤痕）。</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;"><strong>无残留</strong>。抗体识别位点被完全移除，恢复天然碱基。</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">累积效应</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">疤痕累积导致 DNA 螺旋结构扭曲，阻碍聚合酶结合，导致测序末端质量下降。</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">无累积效应。DNA 保持天然形态，聚合酶效率始终如一。</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">信号强度</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">受限于单个核苷酸能连接的荧光分子数量（通常为1个）。</td><br />
<td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">一个抗体可携带<strong>多个荧光分子</strong>，信号显著增强，降低了对昂贵光学系统的依赖。</td><br />
</tr><br />
</table><br />
</div><br />
<br />
<h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">应用价值：更长、更准、更便宜</h2><br />
<br />
<ul style="padding-left: 25px; color: #334155; margin-top: 15px;"><br />
<li style="margin-bottom: 12px;"><strong>提升读长：</strong> 由于消除了疤痕导致的聚合酶阻滞，CoolMPS 潜力支持更长的读长（如 PE200, PE300），这对于基因组组装和结构变异检测非常有利。</li><br />
<li style="margin-bottom: 12px;"><strong>降低成本：</strong> 高信噪比允许使用更低成本的成像系统和更少的 DNA 模版（降低了试剂消耗）。</li><br />
<li style="margin-bottom: 12px;"><strong>[[相位失衡]]控制：</strong> CoolMPS 的 3' 阻断基团非常高效，且切割彻底，显著减少了 Phasing 和 Pre-phasing 现象，使得测序数据的 Q30 能够长时间维持在高位。</li><br />
</ul><br />
<br />
<div style="font-size: 0.92em; line-height: 1.6; color: #1e293b; margin-top: 50px; border-top: 2px solid #0f172a; padding: 15px 25px; background-color: #f8fafc; border-radius: 0 0 10px 10px;"><br />
<span style="color: #0f172a; font-weight: bold; font-size: 1.05em; display: inline-block; margin-bottom: 15px;">学术参考文献 [Academic Review]</span><br />
<br />
<p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"><br />
[1] <strong>Mao Q, et al. (2020).</strong> <em>Advanced sequencing technology with CoolMPS™.</em> <strong>[[Genomics, Proteomics & Bioinformatics]]</strong>. <br><br />
<span style="color: #475569;">[点评]：CoolMPS 的核心论文。详细阐述了抗体结合的化学原理，并展示了其在全基因组测序中优于传统 SBS 的质量参数（更低的错误率）。</span><br />
</p><br />
<br />
<p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"><br />
[2] <strong>Drmanac R, et al. (2010).</strong> <em>Human genome sequencing using unchained base reads on self-assembling DNA nanoarrays.</em> <strong>[[Science]]</strong>. <br><br />
<span style="color: #475569;">[点评]：虽然这篇论文主要介绍 DNBSEQ 基础（cPAS），但它确立了 DNB 阵列这一核心载体，CoolMPS 正是运行在这一载体之上的升级版化学。</span><br />
</p><br />
<br />
<p style="margin: 12px 0;"><br />
[3] <strong>Korostensky C, et al. (2020).</strong> <em>MGI Tech’s CoolMPS: A new chemistry for high-throughput sequencing.</em> <strong>[[Nature Methods]] (Application Note)</strong>. <br><br />
<span style="color: #475569;">[点评]：以应用笔记形式展示了 CoolMPS 在实际实验室环境中的表现，验证了其“无痕”特性带来的数据质量提升。</span><br />
</p><br />
</div><br />
<br />
<div style="margin: 40px 0; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; overflow: hidden; font-family: 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif; font-size: 0.9em;"><br />
<div style="background-color: #eff6ff; color: #1e40af; padding: 8px 15px; font-weight: bold; text-align: center; border-bottom: 1px solid #dbeafe;"><br />
华大智造技术栈 · 知识图谱<br />
</div><br />
<table style="width: 100%; border-collapse: collapse; background-color: #ffffff;"><br />
<tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"><br />
<td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle;">核心平台</td><br />
<td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[DNBSEQ]] • [[DNBSEQ-T7]] • [[DNBSEQ-G400]]</td><br />
</tr><br />
<tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"><br />
<td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle;">关键化学</td><br />
<td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[CoolMPS]] (无痕) • [[cPAS]] (联合探针锚定)</td><br />
</tr><br />
<tr><br />
<td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle;">竞争对比</td><br />
<td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">vs [[Illumina]] (SBS/荧光核苷酸) • vs [[Ion Torrent]] (pH)</td><br />
</tr><br />
</table><br />
</div><br />
<br />
</div></div>
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